Объясните, пожалуйста, почему в бухучете у организации-покупателя отражается НДС по купленным товарам?

Сумбур у Вас в голове.
А где ж еще?
Оплачиваете товар с НДС. А потом смотрите по декларации НДС в налоговую заплатить или подать в возмещению разницу между продажами и покупками.

Уплата НДС - это не только уплата в бюджет. Но и уплата продавцу в соответствии с выставленными им счет-фактурами. Таков Закон. НК РФ :)

Стоимость покупных товаров принимается к учету без НДС. А сумма НДС отражается отдельно на 19 счете с одновременным возмещением из бюджета

Отражается потому, что его можно будет принять к вычету при определении налоговых обязательств по НДС.

Для начала возмем за аксиому :
* поставщик является плательщиком НДС и Вам высталяется счет фактура (который является основанием для вычета) , где в одельной графе отражается сумма НДС
* Вы (покупатель) тоже являетесь плательщиком НДС, и так же выставляете своим покупателям счет-фактуру, где в одельной графе отражается сумма НДС
* Ставка НДС 18%

Например:
1. Вы купили товар/услуги на сумму: 5900уе, в т. ч. НДС 900уе
2.Оплатили поставщику 5900уе, в т. ч. НДС 900уе
3.Вы продали товар/услуги на сумму: 11800уе, в т. ч. НДС 1800уе

Теперь Вы должны заплатить в бюджет НДС 1800уе, но т. к. у Вас есть документ который является основанием для ВЫЧЕТА НДС, а именно Сч-факт поставщика, где отдельной строкой выделено что вы оплатили ему НДС в размере 900уе, при покупке товара/услуги (который кстати он должен в свою очередь заплатить в бюджет, т. к. для него 5900уе является выручкой, так же как для Вас 11800уе) , то ВЫ ПЛАТИТЕ В БЮДЖЕТ 1800уе-900уе=900уе.
Так же как и Вы, Ваш поставщик и Ваш покупатель имеют право на вычет по НДС, потому что у них тоже есть поставщики которые выставляют им сч. -фактуру с НДС.
Ваш покупатель продаст свой товар/услуги, получит выручку и сделает вычет по НДС на сумму выставленного Вами сч. фактуры, т. е. уменьшит сумму НДС которую ему необходимо оплатить в бюджет на 1800уе.

P.S. Но всегда лучше, что бы НДС к оплате превышал НДС к вычету, т. е. платить в бюджет НАДО, потому что налоговая не любит когда НДС нулевой. И помоему если не ошибаюсь в изменениях 2007 года в налоговом кодексе если НДС к вычету превышает НДС к оплате автоматически проводиться проверка, правда не могу точно сказать камеральная или выездная!

Удачи! Надеюсь вы поняли зачем у организации-покупателя отражается НДС по купленным товарам.

Продавец платит НДС в бюджет. Покупатель, получая счёт-фактуру, предъявляет НДС к вычету. Таким образом, налог не уходит в бюджет, а от продавца переходит к покупателю через бюджет.

Но вы же должны знать какую сумму вы возмещаете из бюджета, а какую разницу на реализованный товар должны доперечислить в налоговую.
Например вы покупаете това по цене 1180 руб. в т. ч. НДС - 180 руб. Затем вы производите какую-то продукцию и перепродаете по цене 1770 руб. в т. ч. НДС - 270 руб. В конце месяца вам надо перечислить НДС в бюджет - для этого и необходимо знать сумму НДС по приобретенным товарам. Следовательно 270-180=90. 90 руб. вы должны перечислить в уплату НДС в налоговую.

Прочтите главу 21 Налогового кодекса и Вам всё станет ясно! НДС который покупатель отражает у себя в бухгалтерии уменьшает НДС, который должен уплатить он со своих оказанных услуг или проданного товара!