Налоговая требует оплатить налог с продажи грузового автомобиля купленного в 2011 за 2,5 миллиона а проданного в 2015 г

По идее, налог платить не надо. Прибыли же нет.

все указывают в дкп не более 250 т
а лохи указывают всю сумму и платят налог

Налог с дохода физ лиц, а не с прибыли

Если вы не подавали заявление на применение УСН, (подозреваю, что так оно и есть) то продажа вашего авто попадает под под общую систему налогообложения. В таком случае вам не только НДФЛ 13% надо будет заплатить с суммы реализации, но еще и НДС 18% - 228 814 руб. (1,5 млн. /118*18).

Не 15%, а 13% - НДФЛ. А в остальном да, налог надо заплатить - и ничего тут не сделать. Если имущество использовалось в предпринимательской деятельности, то те вычеты по НДФЛ, которые могут использовать обычные физ. лица, к этому имуществу не применяются.

В принципе ИП может учесть расходы на приобретение такого имущества при расчете налоговой базы... Если он ЕНВД не использует. И делается это отнюдь не по принципу "цена приобретения минус цена продажи", а в порядке, который установлен Налоговым кодексом для учета расходов на приобретение основных средств.
Так что отсутствие прибыли от продажи в данном случае никакого значения не имеет.

Ссылка на то, что автомобиль оформлен на физическое лицо, а не на ИП, также не имеет значения, поскольку имущество физ. лица с точки зрения гражданского права не разграничивается на принадлежащее ему как обычному физ. лицу и как ИП. А в целях налогообложения единственное, что имеет значение, - использовалось или нет имущество в предпринимательской деятельности.
А потому вопрос о том, кем вы выступаете при продаже данного автомобиля (обычное физ. лицо или ИП) от вашего волеизъявления никаким образом не зависит.

Обратитесь за разъяснением на сайт ФНС России -
https://www.nalog.ru/rn77/service/obr_fts/

Ставка единого налога устанавливается в размере 15 процентов величины вмененного дохода, а реализация основных средств по сути не является объектом обложения ЕНВД исходя из таблицы облагаемых налогом видов дохода (НК РФ Статья 346.29. Объект налогообложения и налоговая база.)
Т. о, если имущество приобреталось для предпринимательской деятельности, то и его реализация будет подпадать под налогообложение как ИП,
однако, расчет тогда должен быть по ОСНО (общей системе налогообложения) если не было параллельно деятельности, подпадающей под УСН,
и, составив справку, и приложив её к письму нужно указать что продали дороже, чем купили. ИП (даже уже закрытое) понесло убытки, следовательно базы для обложения нет.
//Скорее всего придётся судиться с ИНФС, т. к. такой ответ вряд ли устроит налоговиков.
PS: если параллельно была деятельность, облагаемая УСН 6%, то от налога по ставке УСН не уйти.

я думаю, что налог платить не нужно, потому что прибыли нет. Но лучше уточнить. Поспрашивайте на юридических форумах, например на этом http://uristinfo.net