Иностранный бизнес и СП в РФ по какой системе налогообложения работает?

Вопрос не имеет смысла.

Любая мало-мальски значимая транснациональная компания, ведущая деятельность в России, имеет в России как минимум одну дочернюю российскую компанию и представительство как минимум одной компании, зарегистрированной где-то еще (иногда материнской компании, иногда одной из дочерних компаний; McDonald's в России, например, в свое время начинался с представительства не американской материнской компании, а ее канадской "дочки"). Налогообложение российской дочерней компании -- россйское; налогообложение операций, проводимых через представительство иностранной компании, определяется договором об избежании двойного налогообложения между Россией и страной, где зарегистирована компания. Соответственно, по каждой значимой сделке принимается отдельное решение -- какая компания должна будет выступать в ней стороной с учетом разницы в налоговом статусе, чтобы по возможности уменьшить налогообложение и административное бремя.

Подсудность договоров опять-таки разная. Споры по договорам, заключенным с российскими контрагентами российской дочерней компанией, подсудны российским судам и рассматриваются по российскому праву. Подсудность договоров, стороны которых находятся в разных странах, определяется по согласию сторон: прямо в договоре записывается -- все споры по настоящему договору рассматриваются там-то и там-то, причем это может быть третейский суд (например, международный коммерческий арбиртаж в Стокгольме или арбитраж при Торгово-промышленной палате России) или суд, в юрисдикции которого ни одна из сторон не "живет" (типа договор заключен между российской компанией и компанией, зарегистрированной в Абу-Даби, но в нем написано, что споры подсудны английским судам и рассматриваются по английскому праву). В отсутствие в договоре указания на такое согласие применяется правило Венской конвенции -- договор считается подсудным судам, находящимся по месту нахождения продавца или поставщика.

И самое главное: для большинства транснационалов Россия -- это второстепенный периферийный рынок. Есть исключения, но их немного.

В основном по ОСН.