Где пишется какая у меня система налогообложения?

Чтобы быть на УСНО нужно в течение 5 дней со дня регистрации в налоговом органе подать Заявление о применение УСНО ( форма 26.2-1). Если вы не подали, то у вас будет ОСНО. УСНО-дело добровольное никакого штрафа за это не полагается, только будете платить теперь налоги по полной программе и кучу отчетов сдавать.
Чтобы работать на УСНО с 2011 года нужно подать заявление с 01 октября по 30 ноября.
А если в вашем регионе введена ЕНВД и ваша деятельность подпадает под это ( розничная торговля, оказание бытовых услуг, оказание автотранспортных услуг, мойка, автосервис и т. д) то обязаны быть на ЕНВД. Заявление регистрации в качестве плательщика ЕНВД подаете в течение 5 дней с начала работы

Если вы не отвезли уведомление, то у вас остается прежняя система налооблажения. А если фирма была вновь образованна - на вас могут наложить штраф за несвоевременную подачу заявления.

Нет свидетельства о праве применения УСН - нет упрощёнки: ) Так-то.

На всякий случай советую для начала обратиться в ту фирму, которая осуществляла регистрацию (либо по доверенности, либо вы делали это лично, что вероятнее) . Если вы фирму зарегистрировали, значит в ФНС были и свидетельство о регистрации получали, как правило, подача заявления на упрощенку делается одновременно. Если на вашем заявление есть штамп ФНС о принятии, возможно это заявление в ФНС все-таки было подано.
Если же все-таки заявление вы не представили, значит по общему правилу применяете общий режим налогообложения со всеми вытекающими последствиями (уплатой всех налогов и представлением отчетности)