Каким числом правильно выписывать счет-фактуры и нужен ли авансовый счет-фактуры?

По правилам НК РФ, когда продавец получает от покупателя аванс в счет предстоящей поставки, он обязан выписать счет-фактуру в течение 5 календарных дней со дня получения аванса (п. 3 статьи 168 НК РФ).
Счет-фактуру на аванс можно не составлять, только счет-фактуру на отгрузку, если аванс и отгрузка произошли в одном квартале, и между этими событиями не прошло 5 календарных дней. Об этом написано в письме Минфина от 12 апреля 2019 г. № 03-07-08/28182.
Но если разница между ними больше 5 дней, даже в рамках одного квартала, потребуется два счета-фактуры.
Также продавец ОБЯЗАН оформить счет-фактуру как на аванс, так и на отгрузку, если поступление аванса и отгрузка произошли в разных кварталах. В этом случае количество дней между событиями вообще не имеет значения. Если же продавец не выставит счет-фактуру на аванс, будут негативные последствия. Ведь в этом случае он занижает налоговую базу.
Так что в Вашем случае без вариантов. Регистрируете счет-фактуру на аванс в книге продаж за 3-й квартал, платите. Потом выставляете в 4-м квартале уже по отгрузке. И зачитываете НДС с аванса. Т.е. в 4-м квартале у Вас НДС по этой сделке по итогу ноль.

Авансовый необходимо выписать 30 сент. т.к. отгрузка будет уже в следующем квартале. А 3 окт.выписываете уже "отгрузочный" счет-фактуру (или упд).

Счёт на оплату от 30 сентября, счёт фактура после отгрузки. С аванса НДС все равно надо платить.

На предоплату выписывается счёт, счёт -фактура на отпущенную продукцию. Вот деньги поступили авансом.

Авансовый счёт ты можешь выписать перед выполнением всех работ.