ИП усн доходы+ патент ( грузоперевозки)

Применяться УСН и ПСН на один и тот же вид деятельности не может. Если берете патент на транспортные услуги, то весь полученный доход учитывается по ПСН. При перевозках между регионами достаточно одного патента, своего региона. Но договор заключаете в своем регионе и автопарк находится в нем же

Если вы брали патент на грузоперевозки, то доход от грузоперевозок и будет относиться к патентной системе налогообложения.

Патентную систему налогообложения имеете право применять только в регионе выдачи патента и действия патента при ПНС и только в том виде деятельности, на который у вас получен патент. Так как патент при ПСН выдают только региональные ФНС и действие патента распространяется только на регион его выдачи -в патенте явно указано в каком регионе действует данный патент при ПСН. В каждом регионе, могут быть свои условия применения ПСН для грузоперевозок и своя стоимость патента.
Поэтому, если у вас патент при ПНС выдан для осуществления деятельности грузоперевозок в Свердловской области, то только при осуществлении грузоперевозок на территории Свердловской области имеете право его применять.
Исходя из этого, если разделите маршрут на два счета или два договора -один только на грузоперевозки по территории Свердловской области, то поэтому счету применяете ПСН. А на другую часть маршрута -грузоперевозки за пределами Свердловской области по другому счету и договору, применяете УСН. Разделять на два счета можно, в принципе, по километражу. А если маршрут не разделите, то тогда только УСН на всю услугу грузоперевозок.