Лишили прав за истечением 2 мес с момента составления протокола. законно ли это?

читайте КоАП РФ :
Статья 4.5. Давность привлечения к административной ответственности
1. Постановление по делу об административном правонарушении не может быть вынесено по истечении двух месяцев со дня совершения административного правонарушения

Исключение :
ч. 5 ст. 4.5
5. В случае удовлетворения ходатайства лица, в отношении которого ведется производство по делу об административном правонарушении, о рассмотрении дела по месту жительства данного лица срок давности привлечения к административной ответственности приостанавливается с момента удовлетворения данного ходатайства до момента поступления материалов дела судье, в орган, должностному лицу, уполномоченным рассматривать дело, по месту жительства лица, в отношении которого ведется производство по делу об административном правонарушении.

Ну и ответьте на вопросы, которые существенны, чтобы Вы получили исчерпывающее разъяснение :
(а) заявляли ли Вы ходатайство о рассмотрении дела по Вашему месту жительства (Вашей регистрации по месту жительства, указанной в паспорте) ; если не заявляли, тогда постановление мирового судьи вынесено с нарушением закона; если заявляли (ставили подпись в протоколе в строке "прошу рассмотреть по месту жительства" - см. ниже
(б) уточните у секретаря мирового судьи или в его канцелярии, когда дело поступило к мировому судье, и посчитайте, выполнено ли условие ч. 5 ст. 4.5 или не выполнено.

Что касается случая подачи ходатайства о рассмотрении по месту регистрации транспортного средства, если таковое подавалось, то по букве закона такое ходатайство не подпадает под исключение ч. 5 ст. 4.5 КоАП РФ, и были случаи, когда суды признавали, что двухмесячный срок истек, и отменяли постановление судьи о наказании. Однако к настоящему времени этот способ ухода от ответственности широко известен судьям, и такие ходатайства чаще всего либо сразу не удовлетворяются, что подкреплено и позицией Конституционного суда РФ 2009 г. , либо суды при обжаловании не отменяют постановления.

Время на пересылку протокола в эти 2 месяца не засчитываются.

Законно. На время пересылки по месту жительства 2-месячных срок привлечения к ответственности прерывается на время пересылки. Нужно было заявлять ходатайство о пересылке по месту учёта ТС, тогда бы срок не прерывался.

по направлению по месту регистрации сроки приостанавливаются.

незаконно. срок давности приостанавливается только если дело пересылают по месту жительства лица. если передали дело по месту учета ТС, то срок давности не приостанавливается. Смотри Постановление Московского городского суда от 8 сентября 2008 г. N 4а-2741/08

Смотря по месту регистрации кого или чего.
Если по месту жительства лица привлекаемого к административной ответственности, то законно.
Если по месту учета ТС, то не законно.