В качестве причин бунта исследователи обычно выделяют тяготы военных походов, недостаточность жалования, оторванность от семей, назначение иностранных офицеров на высшие военные должности. Однако бунт носил не только экономический и социальный, но также политический характер: стрельцы планировали возвести на престол царевну Софью, бывшую регентшей при малолетних Петре и Иване.
Восстание было подавлено правительственными войсками. Сыски по стрелецкому восстанию продолжались до 1707 года, было казнено более тысячи человек. Царевна Софья, которая принимала участие в первом бунте 1682 года, была окончательно отстранена от власти и насильно пострижена в монахини в Новодевичьем монастыре.
