Какие недостатки есть у камер Mocro 4/3 по сравнению с зеркалками? Если брать в одном сегменте.

у мелкой матрицы как раз два недостатка - маленькая матричка а значит и площадь на которую падает свет и ограниченные возможности размытия бокешки

Будет неудовлетворительный результат при съёмке в местах с недостаточным освещением. А именно шумы.

Между кроп 2 и кроп 1,6 практической разницы Вы не обнаружите, это всё досужие разговоры.
Выбор всегда зависит от того что, как, для чего, в каких условиях и какой оптикой Вы собираетесь снимать.
Из общих соображений, я за M10 II, картинка честнее у него, только у него аккумулятора хватает не надолго, особо пока не привыкнете не жечь его понапрасну, зато, аккумуляторы дешевые.

Некорректный вопрос. Лично я считаю микру намного более выгодной и удачной альтернативой в кроп сегменте. Оптика дешевле и она намного выше качеством.
Или вы вообще собираетесь использовать/сравнивать камеру со стандартным объективом?

Не надо так делать.
Тут знаете еще в чем дело? В том, что olympus om-d 10 II - это полная хрень. Тут даже комментировать ничего не хочу.
На текущий момент ЛЮБАЯ беззеркалка того же класса и уровня, что и зеркалка будет стоить МИНИМУМ в 2 раза дороже. Т. е. Вы сравниваете обычную бюджетную зеркалку и совершенно нищебродскую беззеркалку. Тут даже по определению зеркалка выигрывает.
Корректнее было бы сравнивать с Olympus omd e-m5 Mark II или Lumix GX-9, где я всеми лапами буду за них.

Ну, есть конечно. Но это смотря для чего использовать.
Конечно можно нехилое размытие получить, но вот бокешечка это да. Ну и конечно недостаток света, mft очень любит свет. Шумы это смотря на каком оборудовании - у меня GH5S - она мало реально шумит даже на прилично высоких ИСО, но тут надо понимать, что это топовый MFT, ну и объективы надо посветлее. Опять же я ее использую только для видео.
Если вы думаете о фото, то конечно лучше Сапог.

бери микру, она компактная и легкая, по картинке не уступит

Олимпус имеет неплохой стаб, быстрее зеркалки, но быстрее кушает батарейки.

Если беззеркалку, то Sony или FujiFilm (кроп 1.5) из не совсем новых конечно, за умеренные деньги на авито. Со светосильным 1.8 объективом, Olympus E-M10 III выдал кружочки боке вообще унылые, как на мыльнице, по сравнению с Sony NEX-5N старенькой и объективом 1.8 - небо и земля.
Canon 200D на самом деле по шумам тоже далеко не айс. Чуточку лучше M10 II... Но по ДД лучше. Даже моя Sony NEX-5N 2011 каплю лучше по шумам, чем Canon 200D

Никаких недостатков у микры 4/3 нет. Сужу по мыльнице Canon g1x. Цветопередача, резкость и детализация - замечательные. До iso 3200 - можно смело использовать - шумы малозаметны. Про боке - молчу, ибо это сугубо личное восприятие.. (ИМХО)

С микрой жизнь есть, но если смущает, посмотрите еще полутарокроповые беззеркалки. Для статики микра может оказаться даже лучше за счет матричного стаба, а вот для динамики лучше матрицу побольше взять.