после переустановки винды пропали некоторые файлы но на диске С они есть и некоторые не работают требуют переустановки

Так никто не делает. Полагается сохранить нужное на другой партиции диска, отформатировать системную партицию и все поставить заново. Все бывшие ошибки Виндовс подъедает и на диске образуется бардак из нужных и ненужных файлов.
На диске С должна быть ТОЛЬКО СИСТЕМА И ПРОГРАММЫ-ПРИЛОЖЕНИЯ. На него не полагается ничего закачивать, ничего на нем хранить. Все должно храниться только на других партициях.
http://www.ihdd.ru/find-and-mount
Partition Find and Mount — это бесплатный софт для восстановления разделов. Позволяет восстановить разделы при повреждениях MBR или при удалении раздела. При этом найденные разделы монтируются в систему как обычные, только защищённые от записи. Файлы копировать можно хоть фаром :-)
Также, судя по всему, программа позволяет создавать и работать с образами дисков.
Поддер; иваются файловые системы FAT12 (дискеты) , FAT16, FAT32 и NTFS всех модификаций.

"во время установки не чего не удалял Не форматировал а просто переустановил винду"
Перед перестановкой или установкой ОС, как будет вам угодно, всё нужная инфа переносится на другие носители или другие логические диски, с системного, где и устанавливается ОС, добавлю при полном его форматировании. Только этом куда лучшем варианте, всегда ОС будет стоять не криво и нужная инфа останется с вами.

При переустановке Винды затираются начисто стандартные папки. В том числе подчищается реестр и многие программы не работают, т. к. не присутствуют в реестре. А у многих сносятся папки с основными данными. Поэтому - переустанавливай.

в документ сетингс там есть папка загрузок

При переустановке винды диск не плохо бы форматировать. Откуда вы знаете что файлы есть на диске, если они пропали? И как файлы могут требовать переустановки? Устанавливать (переустанавливать) можно приложения, но не файлы

Я занимаюсь ремонтом компьютеров полтора года, я более согласен с первым ответом, лучше всего переносить нужные вам файлы на другой раздел венчестера, т. к некоторые файлы программ сохраняются в тех же каталогах где и виндоус (пример Microsoft Word и др. , после переустановки на диске с виндой ужасный бардак! Компьютер может из за этого тупить!