Основное отличие шины PCI Express от шины AGP. Только отличия! Чем отличаются ?

эта шина была введена вместо AGP так как AGP перестала справляться с прокачкой больших потоков данных, объемы которых постоянно растут.

отличается в основном:

1. Скоростью передачи данных. У AGP она всего 2 Гбайта в секунду (и то у версии AGPx8), а у PCI Express от 5 до 8 Гигабит, в зависимости от версии самого разьема, коих уже несколько от PCI Express х1 до х3 и т. д.
2. Изменена форма разьема.
3. Другое питание.

В общем на деле применение PCI Express повышает скорость работы устройства в него воткнутого. если например современную видеокарту сделать интереса ради под шину AGP то она потеряет большую долю своей производительности в играх, так как ее будет тормозить недостаточная скорость перекачки данных через устаревшую AGP. к примеру, когда видеокарты под AGP еще производились, то из двух одинаковых карт, та что работала на AGP показывала худшую производительность. вот так. В любом случае, AGP - уже давно морально устаревший стандарт и для современной ресурсоемкой графики не подходит и массово не производится. только ограниченно, мелкими фирмами, в угоду владельцев старых ПК.

P.S.: Если касаться вопроса глубже, собственно AGP была разработана в ту пору, когда видеопамять была дорогой и ставили ее на видеоадаптеры мало. и основное назначение AGP было соеденять видеокарту с системной оперативной памятью компьютера. На практике когда она была готова то выяснилось что такая работа сильно тормозила ПК. да и к тому времени все видеокарты уже обзавелись поголовно 64-128 МБ памяти, что полностью покрывало требования всех игр того времени. но посколько на AGP было потраченно уйма средств ее все таки ввели как стандарт. собственно, грубо выражаясь назначение AGP ускорять доступ видеокарты к памяти ПК, а не ускорять обмен данными между памятью ПК и видеокартой. да и делала это AGP кое как. и даже максимальные 2 Гбайта в секунду на практике ей никогда не достигались. ТАК ЧТО ГОВОРИТЬ, ЧТО PCI Express ХУЖЕ ЧЕМ AGP, А ТЕМ БОЛЕЕ, ЧТО ТЕОРЕТИЧЕСКИ PCI Express ИМЕЕТ МЕНЬШУЮ ПРОПУСКНУЮ СПОСОБНОСТЬ КАК МИНИМУМ НЕКОРРЕКТНО. PCI Express вообще универсальная шина, и не только для видеокарт. так что сравнивать ее скорость работы с AGP или тем более AGP с PCI Express - ГЛУПО! У КАЖДОЙ СВОЯ СПЕЦИФИКИ И ЭФФЕКТИВНЕЙ ИМЕННО PCI Express.

и видом, и размером, и - главное - скоростью... а что, почитать теорию не судьба?

Читай http://www.malbred.com/vse-o-videokartah/sloty-rasshireniya-agp-i-pci-express.html

Если в общем, то шина AGP имеет бОльшую производительность (теоретическую - 64x) (полностью все функции так и не были реализованы производителями) , но сильную специфичность - ориентирована исключительно на работу с видеоадаптерами.
Кроме этого шина PCI Express всё равно присутствует в не явном виде, даже если на материнке стояла (стоит) шина AGP.

Шина PCI Express уступает в теоретической производительности шине AGP (теоретическая - 32x), но не имеет выраженной специфики (элементная база шины - простейшие шинные формирователи (комутаторы) при минимуме логики) , в реализации гораздо проще, чем шина AGP. Появилась в не явном виде даже раньше шины AGP.
Более подробно про шины AGP и PCI Express можно почитать тут:
Шина AGP
Шина PCI Express
Отказ от шины AGP прост и понятен - зачем сажать высокоскоростной интерфейс (сложный в логической реализации) AGP на шину PCI Express (всё равно, больше, чем пропускает внутренняя шина PCI Express, скорость не получишь) , когда проще простым увеличением мощности шинных формирователей "вытащить" шину PCI Express наружу в виде не сложного разъёма, а всю логику интерфейса перенести в оконечное устройство, работающее на такой шине.