Подскажите пожалуйста, как быстрее перебросить файлы с одного HDD на другой если есть один SATA 3.0 а остальные 2.0?

в любом случаи будет ограничиваться скоростью 2.0

ДА. Чтение лучше с САТА3 порта, а запись в САТА2 ставь. Это чисто теоретически, не думаю, что для жесткого диска будет сильно заметна разница. Тут всё упирается в особенности работы жесткого диска как такового

правда жизни в том, что HDD в принципе не могут читать/писать на скоростях SATA2 и тем более SATA3, они едва дотягивают до SATA1.
так что совершенно без разницы, как их подключать.
с SSD картина совершенно другая...

Через облако или юсб 3.0

без разницы, hdd не загружают полностью даже sata2

А какая разница? Передача данных всё равно будет идти со скоростью, устраивающей оба HDD, то есть SATA 2.0

Просто вот как ты это у себя в голове представил? Что читать с одного будет быстрее, чем записывать на второй, или наоборот?

А вы в курсе об аппаратных возможностях HDD и что не существует в природе никаких HDD, которые бы работали быстрее, даже чем SATA 1.0, и что SATA 3.0 в мире HDD - это всего лишь хитрый маркетинг нулевых? 200 мегабайт/c * 8 - это всего лишь 1,6 Гбит/c, и не более. А HDD со скоростью 200 мегабайт/c еще попробуйте найти.
SATA 2.0 и SATA 3.0 по-настоящему нужны только SSD, и причем SATA 3.0 нужен только трем SSD: WD Blue 3D NAND SA510/WD Blue 3D NAND, Crucial MX500 и Samsung 870 EVO.

Да возьми и просто подключи другой