Как и кому лучше написать жалобу во ФСИН?

Уважаемый Александр П., Ваша забота об охране здоровья одного из осуждённых, находящегося в колонии её типа (не важно), похвальна (статья 41 Конституции Российской Федерации (РФ) - "каждый имеет право на охрану здоровья" и на заботу о его здоровье со стороны (далеко, даже, от него находящихся) заинтересованных лиц), но давайте разбираться по Конституции РФ с Вашими свободного человека просьбами по существу.
1. Разбор Вами ведётся издалека из-за стен колонии, во-первых, с дежурным помощником начальника колонии (ДПНК), который оставил (судя по Вашему описанию) осуждённого в помещении и не вывел его больного с высокой температурой на проверку на улицу.
Далее этот ДПНК в ответ на просьбу больного гражданина не отвёл его в медпунк, хотя обязан был (бы) это сделать, если бы в этот (выходной) день был бы врач в медпункте.
В пункте 34 (тридцать четыре) Приказа Министерства юстиции РФ от 27 декабря 2017 г. № 285 "Об утверждении Порядка организации оказания медицинской помощи лицам, ... отбывающим наказание в виде лишения свободы" говорится (цитирую): "В исправительных колониях общего, строгого, особого режима, в воспитательных колониях и тюрьмах осужденные прибывают на прием к медицинскому работнику или для выполнения процедур в сопровождении сотрудников учреждения УИС".
2. По смыслу статьи 33 Конституции РФ, согласно которой (цитируется) "Граждане РФ имеют право ... направлять индивидуальные и коллективные обращения в государственные органы ..." - этим правом пользуется сам осуждённый, а у Вас права жаловаться ("в связи в тем, что осуждённый ...") не имеется ни в ГУ ФСИН (на ДПНК), ни в прокуратуру на ДПНК, ни в другие государственные учреждения на ДПНК в этой колонии.
Жалоба от осуждённого на ДПНК подаётся им начальнику этой колонии.
3. Вы можете пожаловаться, во-первых, начальнику колонии (по тому обстоятельству, что ДПНК не вызвал врача на место его работы во внеурочное для этого врача время, но к этому нужно обязательно (дополнительно к жалобе) иметь "проверенные" сведения такой необходимости вызова врача к медпунк в связи с высокой у больного температурой).
4. Если высокая температура у больного держится дольше суток, то этому больному должна быть оказана (квалифицированная) медицинская помощь.

Простой человек не обязан ссылаться на законы в жалобах/ обращениях...

Больной находится в местах лишения свободы, где мобильная связь запрещена. В таком случае Вы откуда узнали об этой проблеме? И Вы решили организовать в этой колонии массовый шмон?

так на оф. сайте ведомства писать жалобу. https://fsin.gov.ru/index.php