Я снял сливной бачок от унитаза, поменял механизм слива воды, сейчас он протекает

Снять унитаз, протереть все насухо ( дно у бачка и место куда он устанавливается) , также резинку. Обезжирить ( ацетоном) . Купить санитарный силикон и прям от души промазать место где стоит резинка ( она в виде типа как овал, шестиугольник) с обеих сторон. Поставить бачек и закрепить болтами Не пользоваться минимум 1 - 2 часа. Старую подводку заменить на новый шланг ( или вырезать ( купить) из резины уплотняющее кольцо)

Ни чем эту манжету смазывать не нужно.. . Просто купите новую, если старая пересохла.... И из под болтов ни чего подтекать не должно, если вы использовали специальный комплект.. . Там болты из нержи и конусные или плоские обжимные резиновые шайбы.. .
Если все шайбы установить в нужных местах, то ни чего течь не сможет. . впринципе...

Под болты должны ставиться резиновые прокладки.

Обмазать всё герметиком.

Как Вам правильно написали - под болты ставить прокладки, а резину между бачком и унитазом герметизируют санитарным силиконовым герметиком, и болты затягивайте хорошенько, только не слишком, чтоб площадка унитаза не лопнула .

При правильной сборке герметик не нужен. Уплотнительные прокладки под болты ставят со стороны воды

герметиком, можно ещё и резинку новую поставить и её тож герметиком и все плотно новыми болтами прикручиваем!
вообще если с сантехникой иметете дело то только новые запчасти ставим-старые обычно подводят

Болты обеспчивают соединение деталей, а не герметичность. Купите новую прокладку и резиновую трубку.