Очень нужна юридическая консультация!!!!

Ваших проблем нет, и писать никуда не надо если и есть проблема так это у того от чьего имени вы подписывали а там вы не числитесь как работник значит и ответственности вашей нет кто вас просил за себя поработать тот и пусть дергается

Вы все сроки более чем пропустили
http://www.consultant.ru/popular/tkrf/14_77.html#p5264
Статья 392. Сроки обращения в суд за разрешением индивидуального трудового спора
Работник имеет право обратиться в суд за разрешением индивидуального трудового спора в течение трех месяцев со дня, когда он узнал или должен был узнать о нарушении своего права, а по спорам об увольнении - в течение одного месяца со дня вручения ему копии приказа об увольнении либо со дня выдачи трудовой книжки.

Для того, что бы что-то конкретно посоветовать, не мешало бы знать, какие именно документы вы подписывали и что за этим последовало : причинен ли ли ущерб, повлекло изменение в оргштатном расписании, повлияло на должностные оклады. и пр.

Вы вопрос некорректно формулируете с юридической точки зрения, тем более размещая его в Уголовном праве. ))
Что, например, может означать: : "Меня сейчас дергают по этому поводу. (хотя я уже не работаю там) " КТО? - Сотрудники МВД? Сам бывший работодатель? А это существенно. Поскольку если сам работодатель, то он может предъявить свои претензии к вам в течение 1 года ( и то в судебном порядке) , если милиция - право такое есть - по заявлению работодателя => не указали ведь что` вы именно подписывали из бумаг.. . может отработка по заявлению на предмет возбуждения уголовного дела... как вариант.
Поэтому, во-первых, успокойтесь, во-второых, хорошо подумайте - каким образом было закреплено ваше заместительство, (приказ, документ, предоставляющий полномочия такого рода.. . т. д. )
В-третьих, не вижу необходимости обращаться с вашей стороны к руководителю с письмами любого рода. Если только вам были выданы при увольнении приказы под роспись и прочая, касающаяся искл. вашей труд. деят-ти на этом предпр. - смысл?
Насчет суда - вопрос- ваши права нарушены? Если нет - пусть обращается тот, кто так считает, а вы не забудьте заявить сроки годичной давности (ст. 392 ТК - ее вам упомянули).. .
Вот примерно так я из вашего повествования вижу ваше "дело" ))

Думаю . что дело не стоит выеденного яйца.
Вы могли выполнять требование своего руководителя, но ваши действия не имели никакой юридической и финансовой силы.
Потому как вы не были офрмлены официально, как и. о. зама директора.
И если кто-то на вашей работе принимал вашу подпись на любом официальном документе, как аналог подписи зама, то это проблемы этого человека.
И только!
Сообщите об этом руководству и пожмите их руку!

Соответственно, писать что-либо руководству нет необходимости!