провели огромную сумму денег через счет нашего ТОО,как узнать кто?

Само по себе зачисление денег на счет юр. лица и дальнейшее перечисление их со счета не является каких-либо налогов. (Раз в налоговую вызывали, то должны были внятно сказать, какой именно налог подлежит уплате) . Запросите в банке выписку об операциях по Вашему счету, а также копии платежных поручений, по которым деньги пришли на Ваш счет и ушли со счета. Из этих документов Вы увидете, кто перечислил их Вам и кому и за чьей подписью деньги были перечислены с Вашего счета, а также назначение платежей и основания.
Далее, по обстановке, нахождение в бугалтерии первичных документов, сверка подписей, наличие этих хоз. операций в бух. учете и отчетности и т. д.
Удачи.

"Наше ТОО" - значит вы собственник?
Запросите и бухалтера первичные документы.
Если вызвали вашего мужа, значит он ответственное лицо и имеет доступ к балансу, пусть посмотрит

Провести но счетам ТОО могли только лица имеющие доступ к бухгалтерии.
Ищите там.
Сторонние лица сделать так не могли.
Или же это ошибка налоговой или ошибка банка.

Для начала проверьте всех кто имел доступ к бухгалтерии, а затем уже думайте.

что значит проведен счет
объясните поподробнее о чем речь
просто выходит, что вы просто ндс вовремя не заплатили

кО ВСЕМУ ПРОЧЕМУ ЗДЕСЬ СКАЗАННОМУ вы можете взять выписку в банке, там же все видно будет кто и откуда и за что перечислил и куда они ушли впоследствии