Про акт камеральной проверки

Если это только безответственность бухгалтера, то никто ваши деньги в доход государства не заберёт.
Акт - не является ненормативным документом налогового органа. Таковым является решение, вынесенное руководителем налогового органа по результатам рассмотрения акта. См. статья 100 прим. НК РФ, пункт 1, а также статья 101 НК РФ, п. 7 . Если ещё нет решения по акту - все вопросы решаете в налоговой . Если есть решение - обжалуете его в вышестоящую инспекцию ( см. статья 137 - 142 НК РФ ) с приложением всех оправдательных документов и просите не применять взыскание со счёта. Для первого раза порекомендовала бы вам обратиться к аудитору, именно к аудитору, а не к юристу.

Если составлен акт проверки, это еще не взыскание, пишите замечания по акту, обоснуйте применение вычетов. То, что вы не представили по запросу документы, естественно останется как нарушение со всеми вытекающими. Если уже вынесено решение о привлечении, то только через суд. Важно не пропустить сроки обращения.

Исправить можно. Нужно подать все в налоговую все документы, которые они запросили. + оплатить штраф.
Могу помочь )))

Слишком мало известно про то что у Вас произошло. Документы по требованию в налоговую отказались предоставлять или предоставили но с опозданием? Как давно получили на руки сам акт? Бухгалтер подал на возмещение "чуть больше 1000" - это что сумма в рублях выставленная к возмещению? Какая сумма была выставлена к вычетам вообще?
Как рекомендация ищите юриста по налогам, подавайте возражения по акту, затем апелляционную жалобу в УФНС и далее в суд.

что интересует ?

предоставить все затребованные документы

По какой причине не предоставили документы