Подскажите, как правильно сделать ящик для хранения удобрений (навоза, компоста, торфа)?

Для начала - поаккуратней с терминами, многих слово удобрения вводят в другую стезю размышлений (это уже в ответах видно) . То, что вы назвали "ящиком" необходимо сделать из грубых досок, можно из обзола (или иначе горбыля) . Суть стенок - не дать развалиться куче до больших размеров. Щели в этом случае выполнят роль аэратора. Внизу необходимо оставить зазор примерно в 30 см. Через него вы будете забирать уже готовый перегной. Сверху действительно, нужно закрыть черным спанбондом (он создаст темноту, а влагу будет пропускать, да и достаточно крепок, чтобы не дать сорнякам прорасти через себя) . Закладывать органику следует только через верх. Всю кучу нужно содержать во влажном состоянии, а на зиму - укрыть и засыпать снегом.

Компост накрывают только на зиму, чтобы сильно не промерзал и работа бактерий не прекращалась. Можно положить на прошлогодний компост черный лутрасил, пропускает воду и не дает всходить сорнякам

Щели 1,5-3см. Крышка не нужна, под дождем процесс быстрее.

Я ящик не делаю. Выкладываю все отходы в течении лета в одну грядку, осенью посыпаю известью и можно накрыть черной пленкой. Весной насыпаю сверху слой земли см 10 и сажаю огурцы. Следущую грядку делаю на новом месте. Осенью прежнюю грядку либо раскидываю, либо просто перекапываю и там можно посадить озимый чеснок.

Мы сделали просто. вкопали от старого забора бревна по четырем углам и к ним прибили по периметру доски. Компост должен проветриваться. Думая, по этой же технологии можно сделать ящик и под удобрения, с той разницей, что погерметичней все это сделать и все!