В январе, когда было тепло взошли лилии а теперь пошли морозы, взойдет ли весной во второй раз и цвести?

взойдет. но насчет цветения неоднозначно -зависит от того. какая группа лилий и когда закладываются цветочные почки. может вообще год промолчать. а потом вылезет -ставьте палочки. чтобы не потерять.

Второй раз - это как? Раз уж взошли, то обратно в землю на зиму не уйдут. Здесь как повезет. Могут и сильно подмерзнуть - летом будете без цветения. А могут и продержаться даже взошедшие и летом зацвести. Зависит от разных причин - степени промораживания, вида самих лилий, насколько готова к зимовке (время посадки и т. д.) . Но главное в вашем случае, чтобы не погибли сами луковицы, а это, к счастью, случается редко.

У меня так же с крокусами, взошли сквозь мульчу. Весной узнаю выжили или нет.

возможно они смёрзнут и луковицы погибнут, нужно было укрыть, но шанс есть, если снегом укрыло землю

Согласна с предыдущим ответом. Немедленно соберите побольше снега с участка и накидайте сверху. Если снега нет, пустите в ход сухую траву, листья, еловый лапник, можно укрыть газетами или бумагой в несколько слоев. Очень хорошо использовать сухие опилки или сухой торф.

А почему вы не замульчевали лилии?

Надейтесь на лучшее всегда, а дальше - как получится... Я свои нарциссы взошедшие при оттепели землей из теплицы присыпала, а они всё равно продолжали расти. А теперь опять морозы...