Как помочь черенкам уличного можжевельника пережить зиму в квартире? Подробности внутри.

Не вижу ...к сожалению... смысла - ни в том ни в другом варианте.
Вот когда в середине лета взяли с растения черенки, их надо было высадить на улицу под те же бутылки. Большинство из них при правильной посадке и уходе уже давно бы укоренились. И у вас бы сейчас не было проблем.
То, что черенки покрылись плесенью и изменили цвет, говорит лишь о том, что не укоренились. Это легко проверить - вытащите из земли - там нет никаких корешков.
Если какие черенки не изменили цвет, то возможно укоренились. В комнатных условиях черенки с маленькими корешками не выживут... хоть опрыскивайте, хоть как.
Есть надежда только, если создать им условия с низкой положительной температурой и высокой влажностью воздуха. Похоже, что у вас таких условий нет... на балконе зимой будет мороз, а в комнате жара и сухой воздух.
Не переживайте. Отрицательный опыт - это нормально.
В следующем сезоне летом (июнь) возьмите новые черенки и посадите под банки на улице.

холодно на сколько? лучше было тогда на улице оставить... черенки сохраняются в прохладных условиях... если покрылись плесенью, боюсь их уже не спасти...

утеплить горшок и вынести на балкон. если и накрывать, то неплотно, чтоб воздух циркулировал свободно. беречь от прямых лучей солнца, если вдруг

В идеале держать при положиьельной температуре около нуля. Причем стабильной или с плавными переходами.

Тепло их погубит, процессы гниения и рост патогенов быстрее, а сил при этом у них всë меньше.

Прошлой осенью невысаженные черенки казацкого можжевельника в горшочках положила плашмя под укрытие к розам. Все выжили, хотя грунт замерзал. Но я их не грела, не было резких перепадов дом-улица.

Можно сделать мини тепличку из поликаобоната с подогревом куском ИК теплого пола. Встречала такую зимнюю передержку на форумах для растений, требующих охлаждения зимой. Но сама не пробовала