Женские шишки - шишкоягоды многочисленные, нераскрывающиеся, с плотно сомкнутыми мясистыми чешуями, диаметром 5-9 мм, продолговато-яйцевидные или шаровидные, вначале - бледно-зелёные, при созревании - чёрно-синие с голубым восковым налётом или без него. Созревают на второй год осенью, состоят из трёх или шести чешуй, сидят на очень коротких ножках. В шишке три (иногда 1-2) трёхгранных раздельных семени, удлинённо-яйцевидных или яйцевидно-конических, жёлто-бурых.
Сбор семени. Для этого необходимо сорвать несколько шишкоягод сине-черного цвета, зеленые трогать не нужно — семена в них еще не достигли нужной степени зрелости.

Всхожесть семян можжевельника низка, поэтому по возможности заготовьте как можно больше ягод.
Собирают их в период с начала сентября по начало ноября.
Созревшие шишки довольно легко отделяются от веток. Поэтому чтобы собрать урожай, достаточно расстелить под деревом ткань и аккуратно потрясти можжевельник за ствол.
"Вопрос: если это ягоды с прошлого года, то значит они прошли стратификацию и пригодны для посадки?"
Семена, которые готовы к посеву, в любом случае после извлечения из ягоды для того, чтобы взошли весной, необходима стратификация (а еще лучше +скарификация). Иначе придется еще годик подождать всходов.