В свою очередь, опасения тех, кто выступает против всё более глобального внедрения ГМО в нашу жизнь вообще и в продовольственную сферу в особенности, базируются в первую очередь на скептическом отношении к самому принципу вмешательства человека в генную область и к эффективности генной инженерии. Основной акцент делается на том, что активные манипуляции с генами проводятся слишком короткое время, чтобы стали очевидными те изменения, которые это вмешательство вызвали в развитии изменённых организмов. Логика такова: если ещё не обнаружили, что ГМО вредны, это ещё не значит, что они не вредны на самом деле, просто нужно более тщательные исследования. Таким образом, аргументация противников генномодифицированных продуктов питания базируется не на имеющихся доказательствах вредности ГМО, а на опасениях, что эти доказательства обнаружатся тогда, когда будет уже слишком поздно. В частности, много говорится о том, что употребление подобных продуктов в пищу может вызвать новые аллергические реакции и общее снижение иммунитета – ведь новые виды белков, образовавшиеся в трансгенных клетках, ещё не знакомы человеческому организму и не ясно, как он на них впоследствии отреагирует. Наиболее ярые противники ГМО призывают к запрету продажи генномодифицированного продовольствия, умеренная же часть, с которой согласны и сторонники ГМО, сосредоточились на информационной кампании. Суть её в том, что покупатели должны обладать возможностью по этикетке продукта узнать, является ли он полностью натуральным или создан с помощью генной инженерии, чтобы самостоятельно и осознанно делать личный выбор.
