Стоит ли хранить сезонную обувь и одежду вместе в шкафу-купе, разделенным перегородкой?

И то и другое надо готовить для хранения.
Одежду вычистить, при необходимости сдать в химчистку. Все зашить, пришить (пуговицы, вешалки, карманы, повреждения) . Повесить на плечики, упаковать в мешки, положить антимоль.
Обувь вымыть, отремонтировать - набойки, молнии, застежки, подкраска. Густо намазать чем надо - кремом для обуви, касторовым маслом, гуталином. В носки обуви напихать мятых газет, при необходимости положить отдушку. Если есть натуральный мех - еще положить антимоль. Сложить в коробки. Зимой в этих коробках хранить летнюю обувь. И хранить эту одежду и обувь в отдельной части шкафа, чтобы не мешала пользоваться - повседневной.
А есть еще шапки, шарфы, перчатки и носки.
Их тоже перестирать, отчистить, и сложить в пакеты с антимолью. Отдельно зимние, отдельно осенние. Меховые шапки для сохранности формы напихать мятыми газетами.
Запаха в принципе не должно быть, разве что лавандовый, от антимоли.

К вас есть другие места для хранения? Тогда храните там. У нас все в одном шкафу, вплоть до трусов и ничего не пахнет.

Если обувь не пахнет, то можно вместе с одеждой. У некоторых обувь пахнет, и конечно, одежда потом неприятно пахнет. В общем как хотите, некоторым всё равно, как они пахнут.

У меня внизу обувь в коробках или тканевых мешочках а наверху одежда, если обувь издаёт запах в отделение для обуви положите какие нибудь ароматизаторы или поглотители запахов, их продают в хозяйственных магазинах

это ж как должна вонять обувь мойте ее тогда прежде чем положить в шкаф

я в коробках храню. А для чего перегородки? Чтобы летняя обувь от зимней вирусов не нахватала?