Заявка на продажу квартиры.Агентство замечает что была незаконной приватизация в 94г(дети не включены).Обязаны отказать?

Если агенство Ваше, это информация прежде всего для Вас - грамотный риэлтор покупателя обязательно обратит на это внимание и сделка просто не состоится.

Продать Вашу квартиру будет сложнее, брать будут только лохи (покупатели без риэлторов, такие тоже бывают:) , для их поиска дают объявления в ЦИАНЕ и ИРР) . Если сделка пройдет, - проблема будет прежде всего у покупателя и у его агенства, проверять чистоту квартиры эта их право и обязанность.
А если в договоре купли-продажи будет фраза "как есть" в нужном месте, то дети могут потребовать через суд долю в квартире у новых хозяев.
Вы же предоставили все документы на квартиру - а если квартира была свободна от возможных требований детей, то Вы конечно же продали её гораздо дороже, а не за те копейки которые указаны в договоре :).

не имеют права-не их вопрос

это их право. отказаться от продажи вашей недвижимости.
свобода договорных отношений.

Тогда детей не включали в приватизацию, если их надо включить в приватизацию это делается через суд

Если те, кто был ущемлен в приватизации уже стали совершеннолетними, то агентство, заключая договор на обслуживание, прописывает в условиях этого договора, что те, чьи права при приватизации были ущемлены, обязуются предоставить нотариально заверенное заявление, что они вкурсе и притензий не имеют.

Агенство имеет право отказать. Они обязаны проверять юридическую " чистоту" квартиры. Потом в суд могут подать и на агенство.

Какая разница агенству! ? Они свои деньги возьмут, а вы потом делайте что хотите со своей приватизацией.