Если комната в собственности более трех лет, значит ли это, что на нее оформленно свидетельство о собственности?

Недостаточно сведений для мотивированного ответа. Если под фразой "комната в собственности более трёх лет" Вы понимаете то, что три года назад кто-то её купил (договор, центр регистрации и пр.) , - то она в собственности именно с того момента. Получение свидетельства не имеет в данном случае решающего значения, если сделку зарегистрировали в федеральной регистрационной службе, т. к. право возникает не с момента выдачи свидетельства, а с момента гос. регистрации сделки (дарение, купля-продажа и т. д.) .
По поводу долей - если квартиру "закоммуналили", либо изначально коммуналка - то у комнат собственники могут быть разными, и в данном случае - не долевая собственность, как например, в случае, если просто приватизировали на 2-х и более членов семьи. Всё дело в том, что у квартиры (если её не "коммуналили", так сказать, т. е. не производили условное разделение с закреплением не доли, а конкретной площади за каждым собственником) - один номер БТИ, один объект недвижимости. Когда "коммуналят" квартиру (т. е. фактическии становится коммунальной: несколько семей, один санузел и одна кухня) , то у каждой комнаты, которую отделили - свой номер, и она считается самостоятельным объектом недвижимости, который можно продать независимо от квартиры. Тогда это не долевая собственность.
В общем, надо смотреть конкретно ваши обстоятельства. Но примерно так.

до 1997 года не было свидетельств о собственности, это мог быть и другой документ, всё до 1997 года есть в БТИ, можно получить справку

после 1997 года - всё в Рег. палате, можно получить справку

собственность возникает только после надлежащего по закону оформления собственности.

Свидетельство о праве собственности не оформляется. Оно выдаётся. По результатам государственной регистрации сделки с недвижимостью. Сначала возникает право собственноси, потом выдаётся свидетельство о праве.