Мне нужен порядок переоформления Служебного жилого помещения принадлежащего Мин.Обороны

Надо видеть бумаги, потому обращаться очно за консультацией к юристу. Дом должен быть передан социальным властям - администрации или хотя бы квартира, чтобы была возможность заключения договора соц. найма. А на сегодня у кого на балансе стоит дом? Какие документы есть на квартиру? Какие претензии к Вам?
Думаю, что возможность только через суд....

Вы вообще не можете никак оформить, если ваш отец жив.. .
Для снятия с жилого помещения статуса служебного необходимо ЖЕЛАНИЕ СОБСТВЕННИКА. У Минобороны такое желание есть? Узнайте в чьем оперативном управлении находится квартира и пусть папа обращается туда с соответствующим заявлением.
Тот факт, что вашего отца уволили по ОШМ без предоставления жилья говорит о том, что в\служащий за 26 календарей не удосужился встать в очередь нуждающихся в получении такового и права на жилье при увольнении не имел. Все гарантии, положенные по ФЗ "О статусе" связаны со статусом в\служащего и умные люди решают свои проблемы до увольнения. Ваш отец мог встать в очередь на жилье в муниципалитете до 2005 года и ему тоже было бы положено жилье (ФЗ "О ветеранах").
А вообще скажу вам по секрету, что есть такая вероятность, что ваша квартира давно передана на баланс муниципалитета. Если это не так, то вполне возможно, что несмотря на все прошлые заслуги вашего отца чиновники могут попросить вас на выход из служебки. Тогда остаются только суды.