Посоветуйте что делать с недвижимостью и прописаными на ней родственниками.

А внучка каким боком к бабушкиному наследству? Она уже в следующей очереди наследует. В равных долях наследуют родители, супруги и дети (если не было завещания) , а внуки уже потом, если ни родителей, ни детей, ни супруги к моменту открытия наследства не будет в живых.

Если внучке нужны деньги, так купите у нее ее долю. Ей только нужно получить св-во о праве собственности для этого. Вам же потом будет проще с обменом. Брат, раз он живет далеко, пусть оформит вам доверенность на получение его документов и пришлет. Сделаете все сами

Внучка вообще не при чем, внуки не наследуют (ГК РФ) , по крайней мере, пока жив родитель-наследник. Ей что, долю подарили? И что значит - в наследство вступили, но права собственности не оформили? Свидетельство на право наследования доли получили? Заявление писали нотариусу о вступлении? Если да, но только в Росреестре право собственности на доли не зарегистрировали, так в судебном порядке можно можно их обязать офомить. Их долю платы за коммунальные услуги и так можно взыскать в судебном порядке, без всякой регистрации долей, раз они зарегистрированы в квартире. Никакого отношения вопросы оплаты коммуналки к наследованию не имеют.

Заставить никак не сможете. Возьмите от них доверенности и оформите наследство и на их доли. Затем предложите выкупить их доли.

Вместе с отцом можете продать принадлежащие вам доли квартиры по правилам преимущественной покупки ( ст. 250 ГК РФ ) и приобрести себе требуемое жильё. Всё равно, к договору мены применяются правила о купле-продаже, если это не противоречит существу мены. При этом каждая из сторон признаётся продавцом товара, который она обязуется передать, и покупателем товара, который она обязуется принять в обмен ( ч. 2 ст. 567 ГК РФ ). Сын и внучка пусть сами о себе позаботятся !

Да уж с внучкой какие то непонятки

Как вы собираетесь делить квартиру? Вам придется иддти в суд. У папы большая доля, внучка при разделе, если несовершеннолетняя должна получить права на комнату - и так минимум две комнаты уйдут. Как дальше будете делить комнату?
Лучше договаривайтесь между собой - долго, трудно, но договаривайтесь, а то друг другу сделаете плохо. Поругаетесь, а желаемого не получите.

не вступившие в право собственности -обламываются со своей долей, потому вас двое, на двоих и делите и почитайте гражданский кодекс часть 3 "наследование"

А каким образом внучка могла вступить в наследство после смерти вашей матери? Что - было завещание на четверых?
Если не было такого завещания, то внучка не является наследницей вашей матери и никакой доли в квартире у неё нет. Наследниками являетесь: ваш отец (муж умершей) , вы и ваш брат (её дети) .
Если было завещание на 4-х, то каждому нотариусом было выдано свидетельство о праве наследования доли в квартире. Каждая доля должна быть зарегистрирована в Госреестре (т. е. должно быть получено свидетельство о праве собственности по завещанию) . Сроков регистрации нет, а "ЗАСТАВИТЬ вступить в права собственности" ни вашего брата, ни внучку нельзя.
Без регистрации никакие сделки не оформляются. Единственное что можно сделать - это выкупить у них доли (для брата без оплаты, но с правом пожизненного проживания, вот только в чьей квартире - вашей или отца?) .