сын 40 лет прописан у своих родителей отец является собственником жилого дома на данный момент хочет выписать своего сын

Конечно, МОЖЕТ, в судебном порядке !

Выписать нет (выписки и прописки нет в России 20 лет) , а обратиться в суд для снятия с регистрационного учета по месту жительства может

В принципе через суд может. Но лучше бы побольше информации. Откуда взялся дом. Как там зарегистрировался сын. Совместное ли имущество с матерью.

Только в судебном порядке.

Согласно ЖК РФ:
Право пользования гражданином жилым помещением прекращается, и он может быть выселен из квартиры:
1) по основаниям, предусмотренным в нормах самого ЖК (например, в случае прекращения семейных отношений с собственником жилого помещения) ;
2) в случаях, предусмотренных нормами других федеральных законов (но не законов субъектов РФ!) , например, при изъятии земельного участка (на котором расположено жилое помещение) для государственных или муниципальных нужд;
3) если это предусмотрено условиями договора (например, если истек срок действия договора найма жилого помещения, заключенного с собственником помещения) ;
4) на основании решения суда (например, если лицо систематически использовало жилое помещение не по назначению и разрушило его) .

Раз отец собственник жилого дома, то ему и решать, кому предоставлять свой дом для проживания, а кому нет,
Проживание в отцовском жилом помещении, даже длительное, не дает совершеннолетнему сыну никаких прав на собственность отца.
Если сын добровольно отказывается выселиться и сняться с регистрационного учета в этом доме, то отец вправе потребовать этого в судебном порядке.
При наличии положительного судебного решения и на его основании сын подлежит принудительному выселению и снятию с рег. учета.

Не может только при условии, имеющегося у сына право пожизненного проживания в доме, если он отказывался от приватизации дома. Нет этого права, отец может снять с регистрационного учета сына через суд, если тот не хочет это сделать добровольно. Сколько лет в доме живет, не имеет значения. Видимо достал родителя....

похоже на то, что реальная проблема лежит не в плоскости жилищного права, а в плоскости человеческих взаимоотношений. Просто так, ни с того ни с всего, выдворять сына из своего дома нормальный отец на станет. Стало быть сын совсем достал. Для 40-летнего мужика висеть на родительской шее просто возмутительно. Пора бы обзаводиться своим жильём.

Выпишет через суд как утратившего право собственности, срок регистрации в квартире человека значение не имеет

да.