нужно ли запятой выделать "прежде всего" в предложении: "бег - это прежде всего эффективный метод борьбы с лишними кг

Надо, это вводный оборот. Его можно выкинуть без
нарушения смысла, он уточняет основной текст.

А вот другой случай, здесь не запятые не нужны:

Придя домой, Вова решил сделать задание по
математике прежде всего остального.

Не нужны. Даже несмотря на то, что тут это вводные слова. Тут отсутствует явное сказуемое - оно заменено тире.

Я посмотрел на www.gramota.ru. Может быть и вводным сочетанием, а может и нет.

ПРЕЖДЕ ВСЕГО, вводное сочетание

То же, что «во-первых, главное» . Подробно о пунктуации при вводных словах и сочетаниях см. в Прил. 2.

Прежде всего, – что это за прическа? И. Бунин, Легкое дыхание. Да и вообще ты это оставь; прежде всего, это невежливо. В. Гаршин, Встреча. «Прежде всего – дикая рябина или садовая? » – «Была дикая, сейчас растет на участке» . А. Яшин, Угощаю рябиной. Однако это было совсем не так. Прежде всего, оба директора имели паспорта, дипломы, пропуска и другие необходимые документы. Самые же сложные дубли не могли иметь никаких удостоверений личности. А. и Б. Стругацкие, Понедельник начинается в субботу.

! Не смешивать с употреблением в роли члена предложения (в знач. «сперва, вначале, в первую очередь») .

«Я всей душой желал быть тем, чем вы хотели бы, чтоб я был; но я ни в ком никогда не находил помощи.. .Впрочем, я сам прежде всего виноват во всём. Помогите мне, научите меня и, может быть, я буду... » – Пьер не мог говорить дальше; он засопел носом и отвернулся. Л. Толстой, Война и мир. Поговоривши с родителями невесты и получив согласие, Лапкин прежде всего побежал в сад и принялся искать Колю. А. Чехов, Злой мальчик. Ухаживая за девицей, обращай внимание прежде всего на наружность, ибо по наружности узнается характер особы. А. Чехов, Руководство для желающих жениться. Прежде всего я прочел сказку о стойком оловянном солдатике и маленькой прелестной плясунье, потом – сказку о снежной королеве. К. Паустовский, Сказочник. Предатель в разведке прежде всего открывает имена друзей… Ю. Семенов, Отчаяние.

То есть, по-видимому, всё зависит от значения, которое Вы придаёте этому слову. Если Вы хотите подчеркнуть значение "во-первых", то нужны запятые, а если значение "в первую очередь", то запятых не нужно.

нет. прежде всего не является вводной конструкцией