какое место в казачьей армии занимал хорунжий и сотник?

Вониский чин "хорунжий" появился у казаков с XVI века (сначала в казачьих общинах, потом в казачьих войсках), а в Табели о рангах была закрплена в 1722 году.
До 1884 года в одном ранге с казачьим хорунжием состояли такие чины как:
- в пехоте фендрик (с 1722 по 1730 г.г.) и прапорщик (с 1730 по 1884 г.г.)
- на флолте - мичман
- в кавалерии - корнет
- в артиллерии - штык - юнкер.

Теперь что касается сотника.
В старое время это командир сотни, но далее, согласно Табели о рангах, это уже второй казачий обер-офицерский чин.
В разное время соответсвие чинов несколько отличалось. Так, до 1884 года сотнику у казаков соответствовали:

Поручик (1730—1884)
Подпоручик в пехоте (с 1884)
Корнет в кавалерии (с 1884)
Прапорщик гвардии (1730—1884)
Сотник у казаков (до 1884)
Хорунжий у казаков (с 1884)
Унтер-лейтенант на флоте (1722—1732)
Мичман на флоте (1796—1884)

После 1884 года соответствие вонискогг чина сотник выглядело следующим:

Капитан-поручик в пехоте (1730—1797)
Штабс-капитан в пехоте (1797—1884)
Секунд-ротмистр в кавалерии (до 1797)
Штабс-ротмистр в кавалерии (1797—1884)
Поручик (с 1884)
Подпоручик гвардии (с 1730)
Подъесаул у казаков (до 1884)
Сотник у казаков (с 1884)
Лейтенант на флоте (1722—1885)
Мичман на флоте (с 1884)

В казачьих войсках: то же, что корнет или прапор. Сотник-офицер.