какие методы наказания за плохое поведение на медкомисии в военкомате слажащие военкомата имеют право применить к призыв

Могут ток ментов позвать и те уже примут! А втихаря могут тя заслать служить хер знает куда (но это уж потом)! А так посылай их в п....

А ЗАЧЕМ в военкомате - плохо себя вести?? ? В итоге зашлют в самую дыру без увольнительных.

Могут наложить административный штраф. Теперь в ВК есть свои юристы!

Юридически: статьи в КоАП РФ (Кодексе об административных правонарушениях) , которую мог бы к Вам применить военком, нет.
Ответственность за поведение в военкомате та же, что и ответственность в любой организации - это статья за хулиганство. Право составлять протоколы - у участковых милиции (причём, как правило, ТЕ участковые в самой комиссии не заседают) , материалы направляют мировому судье.
Ещё работники военкомата (благо сотовые с видеокамерой есть у всех) могут на Вас подать в суд (уголовное дело) за клевету и оскорбление (в зависимости от содержания Ваших выкриков) и даже привлечь к уголовной ответственности за оскорбление представителя власти (в зависимости от того, КОМУ адресованы Ваши выкрики упомянутого содержания) , а это уже не штраф и не исправработы, а лишение свободы на срок до 5 лет (по первости, правда, условно).

в военкоматах истерик хватает, решит психиатр, что делать.

Смотря в чем выразилось "плохое поведение". Если сильно донять военкоматских - могут "команду" какую-нибудь гнилую предписать на Шикотан или еще куда... Могут милицию вызвать - сами к ответственности они привлечь в этом случае не могут. А если их за живое задеть - могут в суд обратиться "по клевете", но это уже из разряда фантастики...