Как сильно я нарушил закон если стою на военном учёте в одном городе, а постоянно зарегестрирован в другом ???

Вы обязаны состоять на воинском учете по месту своего жительства (ст. 10 Закона О воинской обязанности)
Невыполнение такой обязанности является административным правонарушением с ответственностью в размере от 100 до 500 руб.

Ну а теперь как всегда смотрим в Закон, где по этому поводу сказано следующее:
--------------------------------------------------------------------------------------
Статья 10. Обязанности граждан по воинскому учету

1. В целях обеспечения воинского учета граждане обязаны:

состоять на воинском учете по месту жительства (граждане, прибывшие на место пребывания на срок более трех месяцев, - по месту их пребывания) в военном комиссариате, а граждане, имеющие воинские звания офицеров и пребывающие в запасе Службы внешней разведки Российской Федерации и в запасе Федеральной службы безопасности Российской Федерации, - в указанных органах;
---------------------------------------------------------------------------------------

Так что важно где гражданин зарегистрирован, пусть даже временно. Там он и обязан состоять на воинском учете.

Нарушили до стадии штрафа, но это в том случае, если будут вас искать и не найдут.

В ваших действиях нет состава преступления! Гражданин обязан встать на учет в военкомат по месту пребывания, без постановки на учет ему не дадут регистрацию! Тем самым находясь в другом городе, человек находится в поле зрения военкомата, как положено по закону!!!

Статья 20. Место жительства гражданина
1. Местом жительства признается место, где гражданин постоянно или преимущественно проживает.

Статья 3. Регистрационный учет граждан Российской Федерации по месту пребывания и по месту жительства в пределах Российской Федерации
Граждане Российской Федерации обязаны регистрироваться по месту пребывания и по месту жительства в пределах Российской Федерации.

Таким образом, если вы проживаете на территории где стоите на воинском учёте, то в отношении военкомата вы ничего не нарушили. Но при этом нарушаете другой закон и плюха может прилететь уже со стороны ФМС.

Очень сильно... ну как от Земли до неба.

Вы не исполняете обязанности по воинскому учету, что влечет административную ответственность.

Вы практически предатель.