Как мне судиться с военкоматом по болезни

в больницу с острым заболеванием или обострением хронического заболевания.
лучше вызвать скорую помощь.

вариант: заява о желании пройти альтернативную службу. а там то же самое - больница

Ну если областная комиссия тебя признает годным, в части попросишься в госпиталь, там военно-врачебная комиссия решит вопрос о твоей годности.

Годным к воинской службе признает не военкомат, а призывная комисссия. С ней и надо судиться.

Идешь к юристу и составляешь заяву приложив все медицинские документы - потом подаешь заяву в суд.

Но почему ты так долго ждал? Послезавтра уже отправка или что ?

Вот только не надо ЛЯ-ЛЯ. Вас признали годным с ограничением.
Ваши слова о 2-й степени варикоза при обследовании проверить должны были.
Да и именно - 6, а не - 5,5 всё так же проверяется.
Вы НЕ согласны?
НАПИШИТЕ заявление в военкомате о несогласии и просьбой направить на медкомиссию в вышестоящий военкомат.

На имя председателя областной ВВК срочно писать заявление на повторное ВВК.
Его обычно проходят на холодильнике. Все образцы заявлений и жалоб так же находятся там. Если ваши болезни есть в списке болезней, по которым освобождают от армии, то в жалобе нужно указать номера болезней по нумерации списка. Это и будет основанием для повторного ВВК. А так же все записи и ограничения, какие врачами в течении всей вашей жизни были зарегистрированы в вашей мед. карточке.

для начала обжалуйте решение районной призывной комиссии в областной военкомат

тебя повезут в еще один пункт, где будет наиболее тщательный медосмотр.