Атом - это материя? Или одно из свойств пустоты?И что такое-мтерия?

Действительно материя это одно из свойств физвакуума, или как вы говорите пустоты.. Замечательно сказано! А физвакуум это энергия. И материя это энергия, только концентрированная. Но, давайте поставим все с головы на ноги. Потому, что это не атом состоит на 90% из пустоты. Пустого пространства вообще нет и быть не может. Это среда, которая называется физвакуум засорена материей и причем всего лишь на 5%. Причем именно в том месте где находится Вселенная. Поэтому это материя находится в физвакууме, а не наоборот.

Да, атом это материя.
Материя существует в двух формах. В форме вещества и в форме поля.
Так вот как раз вещество и состоит из атомов. Значит, атом это тоже материя, так как составные части материи тоже являются материей.

Объем ядра и электронов составляет, в зависимости от вида атома, примерно - от одной десятитриллионной до двух квадриллионных объема атома. Остальное - "пустое пространство".

слово "пустота" не имеет физического смысла, это философская категория

Атом - тоже материя.
У физического вакуума есть свойства. Атом не является одним из них.
А на свой вопрос Вы сами и ответили в примечании: "Я слышал, что атом состоит на 90% из пустого пространства". Соответственно "атом" и "пустое пространство" - не одно и то же. Ну и не "состоит из", а. грубо говоря, в условных границах атома большая часть объема имеет ничтожную плотность - основная масса атома сосредоточена в его ядре очень маленького объема. Вероятно, Вы слышали именно об этом.

Материя существует в двух формах. В форме вещества и в форме излучения - поля безмассовых частиц. Массивные частицы вещества тоже описываются полями..

скорей из 99,999999999 хз сколько там девяток еще. Так. потому что вполне реально сжать нашу планету до размера яблока и все равно при этом не будет идеально уплотнения материи