Вопрос родом из научной фантастики.

Вспышка ядерного боеприпаса в космосе будет светить, в основном, рентгеновскими лучами. Рентген, ослабевая пропорционально квадрату расстояния, но нигде не поглощаясь, дойдет до линкора и поглотится в его броне. Если линкор близко к эпицентру, верхний слой брони испарится (абляция) и реактивная сила от образовавшейся плазмы ударит в корабль и создаст в нем ударную волну. При взрыве в мегатонну на расстоянии в 1-2 км - линкор будет надежно уничтожен, при более далеком - может выбить иллюминаторы (и экипаж большей частью помрёт) и поломать некоторые системы, плюс электромагнитный импульс, который пожжёт электронику.
Но артиллерийские ядерные припасы не бывают в мегатонну, а только в единицы-десятки килотонн https://ru.wikipedia.org/wiki/Ядерная_артиллерия. Соответственно, радиус поражения будет метров 100-400. Правда, термоядерных артиллерийских зарядов не бывает - при малом размере они слишком неэффективны. Так что стрелять придется ракетами и торпедами.

здесь естественную науку обсуждают, а не фантастику.

Их разбросает в разные стороны, по закону импульса. А остальная энергия бесполезно рассеется по другим направлениям, в виде очень разреженной плазмы. Если не считать других поражающих факторов, такое оружие будет не очень эффективно.

Они друг друга не найдут. (Особенно, после выстрела. Сместятся с орбиты. Артиллерия и термоядерное оружие, немного разные вещи. Но, если взорвать термоядерную бомбу в космосе,,, запрещено.

Невесомость – фигня, а вот вакуум сильно понизит эффективность.
Ядерное оружие работает, главным образом, за счёт большой (ну, относительно большой) области поражения. А какой там главный фактор? Правильно: ударная волна, которая в вакуумах не водится. Если совсем точно, то, конечно, будет чуток, но совсем чуток.
Что ещё? Вспышка, излучение – для брони линкора это фигня.

Короче говоря: если линкоры близко (несколько километров) друг от друга, то быстро угробят себя, если далеко (сотни, или тысячи километров и больше), то будут долго, нудно и уныло палить, пока один из них случайно не добьётся прямого, или очень близкого попадания.
Долго от того, что современные линкоры умеют не только стрелять главным калибром, но и защищаться. А "отбить" снаряд, имея пол часа-час времени - не проблема.

П. С. "Обычный линкор" - оксюморон. Обычный, это какой? Современные, они, по определению не шибко обычные: есть только у США. А может уже и их нет, не помню...

Крышка линкору. Да, ударной волны в вакууме не будет, но тепловая вспышка всё равно линкор на молекулы распылит.