Если боль - защитная реакция организма, то почему она так портит качество жизни? Некоторых даже доводит до самоубийства.

По сути боль - это чувство, побуждающее к прекращению того, что её вызывает. В этом её суть. Если ты чувствуешь боль, то первое, на что она тебя толкает - остановиться, что бы ты не делал. Потому и работает как защита. Проблема в том, что если ввиду нарушений боль нельзя остановить ввиду невозможности устранения её причины, то некоторых это может толкнуть на прекращение самой жизни. Человек-сложная система. А системы ломаются.

эволюции пофиг на качество жизни. Она заточена на то, чтобы особь выжила на природе и оставила потомство. А у кого хронические боли - для вида их и быть не должно. На природе же не болеют подолгу, сразу помирают.

Потому что в дикой природе нет медицины и "качества жизни", боль не бывает долгой: или ты выздоровел, или умер, или тебя съели пока был беспомощен. Боль - защитная реакция, она побуждает животное (человека) совершать какие-то ответные защитные действия. Всё.

Смертей самоубийц по причине постоянной боли куда меньше, чем могло бы быть смертей по причине ее отсутствия ввиду резкого повышения травматичности.

Не защитная, а предупредительная.
Ну, а если игнорируешь предупреждение тогда...

тебе нужно в раздел "Психология"

Боль делают клетки нервов.
Они же повышают качество жизни, поскольку не будет нервов, не будет и мозгов.

Боль никак (и нисколько) не защищает. Боль - это один из методов работы Системы оповещения: подавать сигналы (не только боль), которые побуждают (заставляют: какое уж тут "качество жизни"?) принять меры для защиты организма (Система подавления).

Доводит до самоубийства не сама боль, а невозможность организма (обычно по незнанию, как?) отреагировать на неё.