Почему природный газ и нефть лежат так глубоко в земле?

Потому что те запасы, которые лежали неглубоко, уже давно выкачали.

Залежи нефти массово встречаются в осадочных породах на глубинах от 0 до 6 тыс. м. Но с увеличением глубины мы все чаще находим в пластах не нефть, а газ. На рис. 1 приведено количество нефтяных и газовых скважин, пробуренных в США на глубины свыше 4500 м. И если в интервале 4500-4800 м доля газовых скважин составляет 72,8%, то с ростом глубины до 6000 м она увеличивается до 94%, а при 6600 м составляет 98,7%.

Нефть и газ образуются из растительных и животных остатков, которые накапливаются в илах прибрежных морей и озер,
При погружении осадков на глубины 1,5-2 км температура возрастает до 50-70оС, биологические процессы с образованием метана затухают,
Следующее преобразование органических остатков происходит при погружении залежи на глубину 3-4 км, где температура достигает 120-150оС, именно здесь образуется вся гамма нефтяных углеводородов,
Далее нефть по тектоническим разломам поступает в вышележащие проницаемые пласты и накапливается в ловушках, ограниченных сверху глинистыми породами,
В случае дальнейшего погружения осадочных пород (4,5-6 км) при росте температуры до 200оС происходит термическая деструкция тяжелых углеводородов, образуются залежи с легкой нефтью, газоконденсатом или газом.

Угу. И далеко в тундре, да? ))

Если бы лежали близко, то их бы вычерпали давно.

Есть версия почему так... Земля была плоской. Люди жили с одной стороны, а динозаверы с другой. Летел большой астероид и шваркнул по стороне с динозаверами. Земля погнулась, завернулась и динозаверы оказались внутри, люди снаружи уже круглой Земли. Поэтому нефть под поверхностью.

Как - "так"? Многие месторождения просто сразу на поверхности, как в Азербайджане, Аравии.

Потому что это останки умерших животных много лет назад .

Месторождения, залегающие близко в поверхности земли были и еще есть, но они уже почти полностью выработаны человечеством за 100 лет активной добычи углеводородов.

В Баку вплоть до 50-х годов добывали нефть в простых колодцах, вырытых лопатами.
А вот еще одно место в его окрестностях:
https://www.youtube.com/watch?v=jSigDcCs3hA

Потому что там он образуется.