Сколько слоев в пространстве, как тогда оно вообще устроено?

Вы не просто не понимаете, вы не можете это вообразить. И это нормально. Ученые тоже не могут вообразить в полной мере многое из того, что понимают)

Сколько придумаешь, столько и будет.
Будучи предметом сугубо воображаемым, пространство во всем подчинено твоей фантазии. Не стесняйся, фантазируй!

На рисунке ячейки - это просто координатная сетка, а вообще этот рисунок дает лишь представление об идее деформации пространства на примере двумерной плоскости и от используемой в ТО математической конструкции неэвклидова четырехмерного пространства чрезвычайно далек. Пространство-время ОТО вообще нельзя представить себе наглядно, оно допускает только математическое описание - это так называемое псевдориманово многообразие. Для его понимания (но всё равно не наглядного представления) следует сперва освоить тензорное исчисление.

Ячейки это пространственно-временная сетка. По ней можно посмотреть, где пространство- время деформировано сильнее.
...А Луна тоже деформирует то же самое пространство... вот картинка

Наша трёхмерная вселенная замкнута и представляет собой частицу материи в многомерном пространстве. Для существования гравитации, якобы, нужно 11 измерений. В нашей вселенной есть частицы вещества ( двумерная материя ) и кванты полей (одномерные многообразия, вроде колец ). В многомерных пространствах есть и другие виды материи. Как из двух фотонов может появиться электрон-позитронная пара - подобным образом и могла появиться наша вселенная- из другой, может быть даже с другой размерностью пространства.
Существует и система бесконечной размерности - и это не просто гильбертово пространство - это бесконечно сложное устройство... Бог

Кроме того, что со знаниями у тебя 0, ты ещё и пишешь сверх неграмотно.

Адно яцо для звона