Как создавались атомы? Начиная с водорода и так по таблице Менделеева?

Каждый элемент имеет свои так сказать константы, т. е. текущие параметры своего существования по которым его жестко идентифицируют.. Менделеев собрал в кучу все данные по элементам и систематизировал их в табличной форме, каждой ячейкой которой и является набор параметров присущих конкретному элементу... Когда он их распределил, то увидел, что между одними элементами большая разница в параметрах, а между другими малая... Изначально его таблица была трехмерной, словно на срезе столба.. Потом "объемность" он заменил добавив "периоды" и "группы".. В объеме каждый элемент следует за другим меняя свою частоту творения. На плоскости они все разбросаны, не имеют жесткого порядка. В левом верхнем углу он поставил ДВА ПЕРВОРОДНЫХ элемента, и назвал их элемент "икс" и элемент "игрик"... Они не были не веществом, ни газом, ничем, но они составляли основу каждого последующего элемента таблицы... Своего рода конфигурация (взаимное расположение) "икса" по отношению к "игрику" определяло вид элемента.. ИКс это первый тетраэдр, он же инь, а второй тетраэдр вложенный в него это игрик, она же янь..
Позже, с целью ввести в заблуждение народы западных цивилизаций, икс и игрик идущие с одной точки убрали, а следующие за ними водород и гелий разнесли в разные стороны.
Менделеев Д.И Сочинения
http://vk.com/doc300446642_408691266

Да. Начиная с самых простых и стабильных.

В результате Большого взрыва образовались протоны и электроны (и еще много что, но нам оно сейчас неинтересно).
Потом гравитация и другие взаимодействия собрали их вместе - получился водород.
Потом гравитация поработала еще - появились первые звезды.
Потом в этих звездах начался термоядерный синтез более тяжелых элементов.
Примерно как-то так.

Согласно научному сообществу, Вселенная возникла около 13,8 миллиардов лет назад в результате Большого взрыва. Первые атомы, а именно водородные и гелиевые, образовались через несколько минут после начала Вселенной. Этот процесс называется нуклеосинтезом.

В первые несколько секунд после Большого взрыва были образованы нейтроны и протоны, составляющие ядро первых атомов — водорода и гелия.

Для формирования других элементов необходимы условия, которые могут возникнуть в звездах.

Процесс создания более тяжелых элементов называют восстановлением на основе ядерных реакций. Его происхождение связано с гравитационным сжатием облака газа, которое приводит к возникновению звезды. В центре звезды, когда достигнута достаточная температура, начинаются ядерные реакции, которые приводят к синтезу более тяжелых элементов.

К примеру, кислород — третий по распространенности элемент во Вселенной, образуется в результате слияния ядер углерода и гелия. Тяжелые элементы, включая железо, формируются в звездных взрывах, когда звезда, превратившись в сверхновую, выбрасывает свой материал в окружающее пространство.
https://mks-onlain.ru/otkuda-poyavilis-atomy-vo-vselennoy/

А началось всё с распада электронов... :-)

Силой мысли они создавались. Запомни, мысль первична, материя вторична.

это не известно, говоря честно

Путём "притяжения" протонов к протонам и электронам.
Протоны соединяются друг с другом посредством движения мезонов под большим давлением находясь в недрах звёзд, которые после взрыва рассеивают соединившиеся протоны в космическом пространстве, после чего происходит их соединение с электронами за счёт слабо энергичных фотонов, которые постоянно вылетают как из электронов так и из протонов. образуя разнообразные атомы, конфигурация которых зависит от количества слипшихся в ядро протонов

Смотрим тему "термоядерный синтез"