Площадь озера 260 кв. км, в том числе 38 кв. м занимают острова (их на озере более 160), а площадь всего бассейна составляет 2275 кв. км. Селигер принимает 110 притоков, а из него вытекает лишь одна река Селижаровка.
Озеро, лежащее на высоте 205 метров над уровнем моря, ледникового происхождения. Этим объясняется его своеобразная форма - это не озеро в привычном понятии, а скорее цепочка озер, протянувшихся с севера на юг на 100км. и связанных между собой короткими узкими протоками. Береговая линия протяженностью более 500 км. отличается изрезанностью - поросшие лесом мысы, глубокие вдавшиеся в сушу живописные заливы, разнообразные по форме острова.
За каждым сужением или протокой следует плес. Их на Селигере насчитывается 24, самые большие - Полновский, Осташковский, Кравотынский, Селижаровский, Троицкий, Сосницкий.
Остров Хачин.
Его берег отделен от чистой воды зарослями тростника. Здесь немало удобных подходов и мест для ночлега или дневки. Лес на Хачине сосновый, с примесью ели. В мокрых низинах растет береза и ольха. Самый большой (площадью более 30 кв. км) , но малонаселенный, он влечет к себе любителей собирать ягоды: черники там видимо - невидимо. Кроме того, на Хачине расположено более 13 внутренних озер.
По правому борту - Введенская церковь. Она стоит на погосте деревни Кравотынь (от "кровавый тын") - память о злодеяниях орд Батыя, которые, как рассказывает легенда, установили здесь частокол с человеческими головами. Жестокость завоевателям не помогла: на Селигере они выдохлись и до Новгорода не дошли.
Поросшие смешанным лесом Малый и Большой Колодные острова, Кошелев
Чайка, больший - Великий. На восточном берегу Великого отличные стоянки. Остров очень красив. Это материк в миниатюре. Здесь свои горы-холмы, впадины-долины, луга, хвойные и смешанные леса. Есть дубы, вязы, липы. Северный берег острова крут и высок. Говорят в ясную погоду с Великого видна гора Ореховна, что за Полновом. А до него еще 11 км.
Остров Столбный
Летом 1528 года на безлюдном тогда острове Столбный поселился Нил. Он видел небесные знамения - огненные столбы, которые по описанию очень похожи на пламя от горящего топлива при запуске космических ракет. Дав обет столпничества - не ложиться и не садиться, отшельник прожил на острове 27 лет.
Мощам святого Нила покланялись тысячи паломников.
На Столбенском острове озера Селигер, в 10 км от города Осташкова находится мужской монастырь Нило-Столобенская пустынь.
