Почему столица Болгарии называется - София?

Невзрачная церквушка с мощными стенами, которую можно принять за казенный дом (музей, общественную баню или даже тюрьму) на самом деле – главный храм болгарской столицы. По крайней мере, именно ей город обязан своим нынешним именем.
Ещё в XII—XIII вв. город в общении называли Софией, по имени главного храма — кафедральной св. Софии.
Собор Святой Софии - один из древнейших храмов в столице Болгарии. Именно он дал своё имя городу, прежде называвшемуся Сердик.
Его именем «София» («мудрость» ) ещё в XIII веке люди стали называть и город, а со второй половины XIV века город уже официально в грамотах болгарских царей стал называться «София» .

Собор пыл построен в IV веке на месте более древних церквей, когда-то находившихся на этом месте и разрушенных готами и гуннами. Видимо, он был посвящен памяти мучеников, погибших на заре христианства на располагавшихся неподалеку аренах.
Имя "София" (в переводе с греч. "мудрость") дал храму Император Юстиниан I.

Когда Болгарское царство было завоевано турками, Собор Святой Софии сначала стал мечетью, а затем пожарной вышкой. Уникальные росписи были уничтожены. К тому же храм неоднократно разрушали землетрясения. Но каждый раз храм снова и снова воскресал.

Сегодня это трехнефная базилика с плоским куполом. К сожалению, мало что сохранилось со времени ее строительства - вот разве что остатки мозаики на полу церквей-предшественниц Софии. Однако в ходе последней реставрации в 90-х г. г. прошлого века было сделано немало удивительных открытий. Так, были найдены античные катакомбы.

http://redigo.ru/geo/Europe/Bulgaria/poi/10359
http://vetarsabalkana.com/sofiya1
http://www.republicbulgaria.com/bulgaria-sights/bulgaria-dostoprimechatelnosti-sobor-svyatoy-sofii.html

от греч. σοφία — мастерство, мудрость

Потому что Столица.

В конце 14 века получила название София (по церкви святой Софии).