Емкость в пальчиковых, заряжающихся, батарейках одного размера с не заряжающимися, одинаковая?

Нет.

И, кстати- если Вы говорите о Перезаряживающихся элементах- то Вы говорите об Аккумуляторах.
А аккумуляторы (даже) по вольтажу намного меньше обычных Батареек.
В АКБ всего 1,2 Вольта.
В Батарейке- 1,5.

Из личной практики.
АКБ стоят намного дороже батареек. И (так как) вольтаж у АКБ меньше- то разряжаются они намного быстрее.

Так что- самый простой способ- найти (подобрать) обычные Батарейки по приемлемой цене и пользоваться ими.

(к примеру- лично Я пользуюсь обычными батарейками Панасоник)

И, кстати. Если всё таки решитесь брать АКБ- учтите следующее.
По идее- размеры (длина- ширина- высота) должны быть стандартными для всех "пальчиковых" АКБ и батареек.
Раньше Я тоже так считал.
Пока не купил АКБ самую мощную (по ёмкости), которую смог найти в магазинах.
И в отсек для батарейки (в мышке) такая АКБ не поместилась.
Разница в габаритах оказалась не значительная (и не заметная) - всего то в каких то пол миллиметра.

(кстати. Та АКБ с не стандартными габаритами так и провалялась без дела и пользы. Недавно Я решил её использовать.
И (так сказать) обломался. АКБ полностью деградировала- перестала принимать даже зарядку. А стоит АКБ (как уже сказал выше) намного больше чем Обычная батарейка.
Так что- (Моё Личное Мнение) лучше таки обычные батарейки

Нет. Батарейки бывают разного типа - щелочные, солевые и литиевые От типа зависит емкость, в том числе. А у разных аккумуляторов - тоже бывает разная емкость, она на них указана, как правило.

У разных батареек даже одного размера может быть разная ёмкость. Так что сравнивай конкретные примеры.