Почему кофе действует на организм, как слабительное?

Вам к гастроэнтерологу.
Кофеин стимулирует (возбуждает) центрально-нервную систему. Возможно у вас от кофе вегетативная реакция в виде неоформленного стула (нейронная кишечная дисфункция).

В зёрнах кофе содержится более 3000 различных элементов и соединений, но наибольшее значение в этом вопросе имеет хлорогеновая кислота. Вот как минимум две причины, почему от кофе слабит:
Хлорогеновая кислота вызывает повышение кислотности и стимулирует выработку желудочного сока, что в свою очередь, приводит к улучшению пищеварения, его усилению. Белки перевариваются быстрее и переходят в кишечник.
Кислота провоцирует выработку гормонов гастрина и холецистокинина. Они активизируют перистальтику кишечника, и пища продвигается дальше. Активнее работает вся мускулатура, поэтому через некоторое время после чашки кофе наблюдается явное желание посетить туалет.
Есть и ещё одна причина, которая не связана с хлорогеновой кислотой. Многие люди выпивают чашку кофе с утра примерно в одно и то же время, перистальтика и пищеварение усиливаются, и организм привыкает к такому эффекту. И даже если не выпить кофе, в определённые часы можно ощутить позывы. Поэтому не все отмечают слабительный эффект именно от кофе, приписывая его саморегуляции организма и привычке, хотя истоки кроются именно в чашке любимого утреннего напитка.
Слабительный эффект от кофе – это нормальная реакция, показывающая, что все органы реагируют на раздражитель правильно.

Не знаю, но кофе перед работой не пью... Крепкий чай

Похоже на аллергию.