Вы видите принципиальную разницу в именах: Данил - Даниил - Данила, Софья - София, Наталья - Наталия и т. п.?

Данил, Данила - это русское имя
Даниил - еврейское

вот и разница

честно говоря, Даниил мне нравится больше

введите имена
http://www.goroskop.org/cgi-bin/sovm.cgi

Имена действительно разные. Да, разница принципиальна, когда речь идет о документах. А называть вы можете как хотите. Знакомые дочку Лену дома зовут Лешкой, другие сына Александра и вовсе Лексусом)

документально принципиально даниил-данила.. да и так, данила простецкое, а даниил солидное еврейское

нет.
главное что бы во всех документах писали как в паспорте или св-ве о рождении. а то могут быть проблемы.

Ну говорят что Ирина и Арина это одно и то же, а я вот себя Ариной не вижу ну никак)

Зовите как хотите, но если в паспорте Наталья, а в свидетельстве о рождении Наталия, то это уже другой человек.

я не вижу принципиальной разницы, но для кого-то это важно. Поэтому спросить не мешает, чтобы потом не огорчить родителей, если не правильно назовешь. Я знаю, что есть люди, которые дочь Ирину никогда не позволяют Ира называть, и это их право. Моя свекровь говорит: я вашего Назария все равно буду звать Назар, а я говорю, что научу его не откликаться на чужое имя, и как хочешь так зови.
У каждого свое понимание. Поэтому я часто спрашиваю, как правильно называть ребенка, или человека с которым знакомлюсь (хотя, обычно называю так. как с первого раза представились).

В разговорной речи не принципиально. Моего знакомого Дмитрия везде звали Димой, а дома - Митя.

вы можете называть как хотите. а вот в документах, справках и т. п. нужно писать точное имя, каждую буковку.

Разница есть:
Даниил/София/Наталия - это древнегреческие/ латинские имена
Данил/Софья/Наталья - уже "подогнанные" под славянские языки имена