Наследство по закону или обязательная доля?

Обязательная доля в наследстве (ст. 1149) - это и есть одно из оснований наследования - по закону, что Вам и сказал нотариус. Не вижу противоречий.
В данном случае мать сама распорядилась, составила завещание на среднюю дочь.
То, что как пишет автор, "Младшая отказывается от своей доли в пользу средней почти сразу после написания завещания (2004 г.), " - это ничтожно. О каком отказе от наследства могла идти речь ПРИ ЖИЗНИ матери. Всего-навсего слова, устная договоренность, не более.

Обязательная доля (которую могут получить наследники нетрудоспособные или инвалиды) составляет не менее 1/2 от того, что причиталось бы этому наследнику при наследовании по закону (т. е. если бы завещания не было) . Если у матери было 3 наследницы (если у нее не было мужа, других детей) , значит, по закону им причиталось бы по 1/3. Обязательная доля - не менее 1/2 от 1/3 = 1/6.
Таким образом, средняя дочь по завещанию получит 5/6 от квартиры, старшая дочь по закону (как обязательный наследник) получит 1/6, младшая не получит ничего.

Libra пишет: "Отказ от обязательной доли в наследстве в пользу кого-либо недопустим. Нотариусы обходят это требование "ненаправленным" отказом, т. е. без указания выгодоприобретателя".
Нотариусам и "обходить" ничего не нужно. Получать или не получать обязательную долю - это ПРАВО, а не обязанность наследника, значит, если старшая дочь не захочет получать обязат. долю, она напишет заявление, и всю квартиру получит наследник по завещанию. Действительно, отказ от обязательной доли в пользу другого лица (например, в пользу младшей дочери) не допускается.
Возможен еще вариант, почему, как пишет автор, "недавно нотариус поменял свое "по закону" на "обязательную долю".
Возможно, старшая сестра подала у нотариуса заявление как наследник по закону, и нотариус (не зная о завещании) предварительно посчитала ей долю - 1/3, а через некоторое время средняя сестра предъявила завещание, вот и оказалось, что у старшей только право на 1/6 - обязат доля. Даже если средняя не проживает там 17 лет, могла документы по почте прислать, или с представителем по доверенности.

Если есть завещание, то наследники по закону наследуют только если имеют право на обязательную долю. Независимо от завещания. Обладают нетрудоспособные наследники. В данном случае инвалид. Вы не написали, на кого составлено завещание.

На кого завещание оформлено, осталось не ясно. . Уточните этот момент.

Если все имущество завещано средней сестре, то право на обязательную долю есть у старшей сестры. Она наследует не менее половины того, что причиталось бы ей при отсутствии завещания и при наследовании по закону. У младшей сестры нет прав на наследство. От чего она отказывалась, непонятно.

Обязательная доля в наследстве - при существовании завещания нетрудоспособные наследники, не упомянутые в завещании, имеют право на обязательную долю в наследстве, которая составляет не менее половины от доли, которая должна была бы наследоваться при отсутствии завещания. Т. е. если по закону сестрам должно было бы достаться по одной трети наследства, обязательная доля составляет 1/6. Отказ от обязательной доли в наследстве в пользу кого-либо недопустим. Нотариусы обходят это требование "ненаправленным" отказом, т. е. без указания выгодоприобретателя. Просто дают подписать заявление "об отсутствии намерения принимать наследство" (как-то так)

А что значит "нотариус поменял" Насколько я понимаю, сейчас 2 наследницы, старшая и средняя дочери?
Если хотите разобраться, пишите в мыло