Ст. 111. ч. 1 Эксперт не связывает черепно-мозговую травму с внутричерепной гематомой, такое заключение мог дать толь

Коротко по сути вопросов.
1. Действия следователя законны в части окончания предварительного расследования, поскольку он посчитал достаточным собранных доказательств для этого и предъявления материалов дела для ознакомления.
2. С заключением по СМЭ знакомят отдельно, при этом составляется протокол об ознакомлении с заключпением эксперта и с постановлением о назначении экспертизы (отдельный протокол) . В этом протоколе (об ознакомлении с заключением) Вы (обвиняемый, защитник) или в отдельном (своем протоколе) потерпевший делает заявление о несогласии с выводами (или ставит под сомнение исследовательскую часть) , при этом мотивирует свое несогласие.
3. Если это не было сделано в отдельном протоколе, то в протоколе ознакомления с делом в порядке ст. 217 УПК РФ делаете такое мотивированное заявление и ходатайствуете (опять же мотивированно) о назначении и производстве повторной СМЭ (при этом повторная поручается другому суд. мед. эксперту. А лучше (чтобы в будущем не было неясностей и противоречий, сомнений) комиссионную СМ-экспертизу.
4. После окончания следствия (о чем Вас должны уведомить) никакие экспертизы не назначаются и не проводятся. Т. о. Ваш вопрос успеть ли за неделю ознакомления с делом переделать экспертизу некорректен.
Вывод: Если действительно так все обстоит, заявляйте мотивированное и обоснованное ходатайство немедленно. На отдельном листе и вручайте следователю (лучше через канцелярию с отметкой, чтобы не потерялось) . Потом аналогичное в протоколе ознакомления по ст. 217 УПК РФ. В любом случае, даже если следователь откажет, то руководитель или прокурор не пропустят в суд с неясностями и противоречиями, да и в суде у Вас будет возможность обращаться к данному СМ-исследованию и требовать от суда назначения такой экспертизы.
Все разрешимо, удачи.

О нарушениях норм УПК РФ, если они имели место в ходе предварительного расследования, вы можете заявить (мотивировано) в ходе судебного заседания. И потом у вас остается еще возможность обжаловать и приговор суда.

Гематома может быть образована после черепно-мозговой травмы. Но никак не может внутрення гематома явится причиной травмы.
В любом случае эксперт наверно опрделил давность гематомы и сопоставил с периодом получения травмы, видимо оказалось, что одно с другим по времени и месту расположения не соответствуют.

....следователь долже всесторонне и полно раследовать уголовное дело, после чего направить дело в суд (если доказана вина ), если нет - прекратить за отсутствием состава, события и т. д. в процессе расследования он обязан ознакомить подозреваемого (обвиняемого с назначением и с заключением всех проводимых экспертиз по делу, где можно заявлять согласие, несогласие с заключением и право требовать назначение повторной экспертизы и т. д. , но это должно происходить до момента начала ознакомления с материалом дела.... (все что я понял из вышенаписанного)