Могу ли я подать ходатайство об истребовании доказательств одновременно с подачей заявления об установлении факта,

По смыслу гражданского процессуального закона, Вы должны представить доказательства невозможности самостоятельного получения доказательств. В этом случае в пределах предмета иска (ст. 196 ГПК РФ) суд обязан оказать Вам содействие в представлении доказательств.
В Вашем случае необходимо представить отказ ИФНС и обозначить ходатайство об истребовании в ИФНС соответствующей выписки из ЕГРЮЛ.
По смыслу закона не представление доказательств не является основанием для оставления заявления без движения. Закон в этой части расширительному толкованию не подлежит.

Согласно статье 266 ГПК РФ, заявление об установлении факта, имеющего юридическое значение, подается в суд по месту жительства заявителя, то есть по месту жительства истца

Помимо указанных выше документов - свидетельств, выдаваемых органами ЗАГС, и решений судов - в подтверждение искомого факта с помощью суда могут быть истребованы и получены самые разнообразные письменные доказательства (документы) . Для этого перед судом необходимо заявить ходатайство об истребовании этих документов в тех учреждениях, в которых они находятся. В ходатайстве должны быть указаны орган, предприятие, учреждение или организация, куда обращен запрос, документ, который находится в их распоряжении, и важные для рассмотрения дела обстоятельства, которые могут быть подтверждены с помощью этого документа

можете

Пишите ходатайство в суд. Прошу истребовать такие-то доказательства, находящиеся там-то, ввиду невозможности их получения.
Ходатайство подаете судье до заседания, на стадии до судебной подготовки. Если суд находится в другом городе, посылаете письмом, заказным с уведомлении о вручении.
Так же и с налоговой. Прошу предоставить данные о том и том. Указанные сведения необходимы для предоставления в суд. Письмо с уведомлением о вручении. Посылаете на имя начальника налоговой. По истечению 30 дней, если нет ответа (любого) , ходатайство в суд.