Как платить алименты если работаешь по договору ?

Все работают по договорам. А алименты платишь как обычно, определенный процент, как указано в решении суда либо через бухгалтерию либо через приставов и радуешься жизни.

решение суда состоялось? Или было оформлено соглашение об уплате алиментов?

В размере от дохода.

Пока не определишься, следует вносить любую сумму, чтобы приставы видели, что ты не отлыниваешь от обязанностей. А с другой стороны, у тебя исполнительный лист на руках. Там всё написано. Иначе погрязнешь в долгах и испортишь биографию детям.

перевод в размере если 1 ребенок, то 1/4 от дохода, если 2 ребенка-1/3 от дохода, если 3 и более, то 50%. Только укажите назначение платежа и квитанции сразу подписать и отксерокопировать, так как через полгода на квитанциях вообще ничего не прочитать.

При имеющемся судебном постановлении о взыскании алиментов - Если договор не трудовой, то по средней ЗП по России, 48 030,00 руб. Пристав так же насчитает долг по ст. 113 СК РФ за вычетом того, что вы выплатили, предоставив документальное подтверждение выплат.
При отсутствии судебного постановления и нотариального соглашения по уплате алиментов - вы просто будете оказывать матпомощь и не более. Алименты с даты обращения за ними в суд платятся, ст. 107 СК РФ.
Для изучения и применения - "Методические рекомендации по порядку исполнения требований исполнительных документов о взыскании алиментов" (утв. ФССП России 19.06.2012 N 01-16).

Переводи сам, сколько требуется.

так же как и всегда, бухи удержат...

самостоятельно перечисляй деньги на счет от среднемесячного заработка. Сотрудничай с приставами, иначе они будут привлекать тебя к ответственности, в том числе к уголовной