Как правильно написать код главной страницы, чтобы поисковик распознал разделы сайта?

Поисковик и так распознает разделы вашего сайта. Вот несколько основных моментов.

Чтобы стимулировать этот процесс:

1. Используйте файл sitemap.xml (онлайн генератор - http://www.mysitemapgenerator.com/start/free.html)
2. Не стоит для ссылок "A" указывать атрибут title, если внутри ссылки есть текст (если картинка - то пожалуйста)
3. Заполните мета-теги title, description keywords.
4. мета title должен совпадать с H1. Желательно полное совпадение, ну или хотя бы tittle, содержащий
основные ключевики из H1. Как точно, можно сказать только на конкретном примере.
5. Не борщите с ключевыми словами. Чем их больше, тем шире тематика страницы и тяжелее её продвинуть.

И туча других правил. Ищите в интернете - всего в 1 комментарии не перечислить.

Насчёт меню:

1. Лаконично и просто - это хорошо. 1-2 слова на 1 пункт (лучше 1 точное слово) .
2. 5-6 пунктов главного меню - это в идеале. Хотя дополнительный рубрикатор слева
тоже не повредит.
3. Не стоит полностью дублировать навигацию в подвале сайта.
4. Если в качестве содержимого ссылки IMG, то непременно должен быть и ALT.

Заранее предполагаю споры по поводу того или иного пункта. Сразу скажу, что
мнение каждого SEO-оптимизатора субъективного: в чём-то совпадает, в чём-то нет.
Точных алгоритмов не знает никто. Хотя некоторую информацию вы найдёте в хелпе яндекса.

Обязательно прочтите, если не читали. http://platon.ya.ru/replies.xml?item_no=2236
(рекомендую в закладки как "ТАБУ" или незыблемую истину!)

Списки (для меню) забыть. Они для СПИСКОВ! А текст в