Почему деятельность компьютерных вирусов незаметна в большинстве случаев?

Почти все современные вредоносные программы не пытаются нанести прямой вред пользователю, выгоды от этого нет. Гораздо выгоднее, например, рассылать спам, или показывать вам рекламу. Или позже заставить компьютер выполнить DDoS вместе с другими зараженными компьютерами. К тому же многие вредоносные программы формально не являются вредоносными, потому что "мы будем показывать вам рекламу" было написано на стопицотой странице лицензионного соглашения, которое никто не читает.

Потому что создание умного хакера не рубит сук, на котором сидит :)
Вообще задача толкового вируса не сломать что-то, а украсть и отослать хозяину.

Не каждый вредоносный код это вирус. Большинство из того, что нашел веб может быть бэкдорами, которые сами по себе ничего не делают, просто дают доступ к компьютеру извне. Другие встраивают себя в браузер и ничего не делают, если он не запущен. Видимого эффекта может и не быть, ваш компьютер будет использован как часть ботнета, для атак на другие компьютеры или еще каких целей. Вы наверно застали те времена, когда вирусы писали студенты и школьники с целью проверить свои навыки, да попугать доверчивых пользователей. Сейчас их пишут с целью наживы и нет никакой выгоды в том, чтобы явно выдавать себя в системе.

потому что с рекламы им бабки идут.

Разнообразные ддос-атаки наносят и вред различный. Нужно системы защиты качественные ставить.

потому что сидит чайник.
по-твоему, должен был комп на воздух взлететь и весь дом за собой прихватить?